Kollagen Typ XX, alpha 1
Bändermodell von Kollagen Typ XX, alpha 1 nach PDB 2DKM
Andere Namen
  • Alpha-1-Typ-XX-Kollagen
  • Kollagen Alpha-1(XX)-Kette
  • Kollagen Alpha-1-Kette Typ XX

Vorhandene Strukturdaten: PDB 2DKM, PDB 2EE3, PDB 2EKJ

Eigenschaften des menschlichen Proteins
Masse/Länge Primärstruktur 1.284 Aminosäuren, 135.830 Da
Isoformen 3
Bezeichner
Gen-Namen COL20A1 ; BA261N11.4; KIAA1510
Externe IDs
Vorkommen
Homologie-Familie Hovergen
Übergeordnetes Taxon Euteleostomi
Orthologe
Mensch Hausmaus
Entrez 57642 73368
Ensembl ENSG00000101203 ENSMUSG00000016356
UniProt Q9P218 Q923P0
Refseq (mRNA) NM_020882.2 NM_028518.1
Refseq (Protein) NP_065933.2 NP_082794.1
Genlocus Chr 20: 63.29 – 63.33 Mb Chr 2: 180.98 – 181.02 Mb
PubMed-Suche 57642 73368

Kollagen Typ XX, alpha 1 ist ein fibrillenassoziiertes Kollagen, das vom Gen COL20A1 codiert wird. Es bildet Homotrimere, die wiederum Kollagenfibrillen vom Typ XX formen.

Eigenschaften

Kollagen Typ XX, alpha 1 befindet sich meistens in der Epithelschicht der Hornhaut, der embryonalen Haut, dem Schwertfortsatz und in der Sehne. Das Gen COL20A1 beeinflusst den Prozess des Zartmachens von Broilerfleisch. Möglicherweise scheint COL20A1 ein Onkogen zu sein.

Einzelnachweise

  1. ↑ M. Koch, J. E. Foley, R. Hahn, P. Zhou, R. E. Burgeson, D. R. Gerecke, M. K. Gordon: alpha 1(Xx) collagen, a new member of the collagen subfamily, fibril-associated collagens with interrupted triple helices. In: J Biol Chem. 276. Jahrgang, Nr. 25, 22. Juni 2011, S. 23120–23126, doi:10.1074/jbc.M009912200, PMID 11274142.
  2. ↑ K. Piórkowska, K. Żukowski, J. Nowak, K. Połtowicz, K. Ropka-Molik, A. Gurgul: Genome-wide RNA-Seq analysis of breast muscles of two broiler chicken groups differing in shear force. In: Anim Genet. 47. Jahrgang, Nr. 1, Februar 2016, S. 68–80, doi:10.1111/age.12388, PMID 26592359.
  3. ↑ Chi-Cheng Huang, Shih-Hsin Tu, Heng-Hui Lien, Jaan-Yeh Jeng, Ching-Shui Huang, Chi-Jung Huang, Liang-Chuan Lai, Eric Y. Chuang: Concurrent gene signatures for han chinese breast cancers. In: PLoS One. 8. Jahrgang, Nr. 10, 3. Oktober 2013, doi:10.1371/journal.pone.0076421, PMID 24098497, PMC 3789693 (freier Volltext).
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