Als Kommission Santer wird die Europäische Kommission unter Kommissionspräsident Jacques Santer bezeichnet, die von 1995 bis 1999 im Amt war. Sie folgte der Kommission Delors III nach. Gegen Ende ihrer Amtszeit wurde die Kommission Santer von einem Korruptionsskandal um Édith Cresson erschüttert. Nachdem das Europäische Parlament mit einem Misstrauensantrag gedroht hatte, trat die Kommission am 15. März 1999 geschlossen zurück. In der danach gebildeten Übergangskommission Marín blieben allerdings Mitglieder und Ressortverteilung identisch, lediglich der Kommissionspräsident Santer und der bisherige Vizepräsident Manuel Marín tauschten die Posten. Erst für die Kommission Prodi, die ihr Amt Ende 1999 antrat, wurden neue Kommissionsmitglieder ernannt.