Erste Ämter (1644–1647)

Nach dem Studium der Philosophie, Theologie und Geschichte an der Universität Padua, wie für einen Patrizier üblich ohne Abschluss, bekleidete Marcantonio Giustinian verschiedene öffentliche Ämter. Wie die meisten jungen Patrizier, so begann er seine Laufbahn mit einer Beschäftigung als Savio agli Ordini – jeweils im Halbjahr April bis September 1644 und 1645. Am 17. April 1647 wurde er zum Governatore di galera gewählt, ohne jedoch Erfahrung im Bereich der Seefahrt und der Galeeren aufweisen zu können. Diese Wahl hing mit dem Krieg um Kreta zusammen, der 1645 begonnen hatte, und der sich bis 1669 hinzog. Danach blieb er ein Jahrzehnt lang der Politik fern, während Girolamo als Botschafter in Spanien, im Reich und in Rom fungierte.

1656 starb jedoch Girolamo, ebenso wie ein weiterer Bruder, Francesco, der einzige der Söhne, der geheiratet hatte. Doch waren dessen Kinder noch sehr jung. Dieser doppelte Verlust zwang die Familie, ihre Strategie neu zu überdenken, den Söhnen neue Rollen zuzuweisen.

Neue Familienstrategie, Magistraturen (1656–1664)

Marcantonio musste sich nun der Politik öffnen. Dem seinerzeitigen Saviato agli Ordini waren nicht die sonst üblichen Saviati di Terraferma und del Consiglio gefolgt, die sonst den Zugang zum Collegio ebneten, und damit zum Machtkern. So konzentrierte er sich auf eher technische Magistrate, vor allem solche, bei denen die Finanzen eine Rolle spielten. Von Juli bis Oktober 1656 war er also Depositario del Banco Giro, um dann erst wieder vier Jahre später als Provveditore alle Biave aufzutreten, nämlich vom 13. März 1660 bis zum 12. Juli 1661. Dabei war er mit der Versorgung Venedigs mit Getreide, vor allem Weizen betraut, aber auch mit der Verwaltung der dazu nötigen Depositen. Zu dieser Zeit war der Krieg um die Insel Kreta gegen die Osmanen noch in vollem Gange. Daher war die Versorgung der Mannschaften mit Schiffszwieback (biscotti) extrem wichtig und erforderte erhebliche finanzielle Mittel. Giustinian gelang es mit naturwissenschaftlichen Methoden Betrügereien der pistori nachzuweisen, der Feilbäcker, die verurteilt wurden.

Ab dem 2. November 1661 war er zwei Jahre lang einer der sieben Esecutori delle deliberazioni del Senato, Exekutoren der Senatsberschlüsse. 1663 bis 1664 war er einer der beiden Männer, die den Provveditori sopra Danari zur Unterstützung beigegeben wurden, ab dem 26. Juli 1664 zählte er zu den Conservatori delle Leggi.

Botschafter in Paris (1664/65–1669)

Schließlich wurde er am 6. August 1664 zum Botschafter in Frankreich gewählt. Dort kam er allerdings erst im November 1665 an. Nach Paris begleitete ihn sein jüngerer Bruder Giovanni. In Ludwig XIV. sah Giustinian den mächtigsten König Europas. Als er am 6. Februar 1669 seine relazione, seinen Abschlussbericht, vor dem Senat hielt, forderte er implizit dazu auf, das merkantilistische System des Ministers Colbert auch für Venedig zu prüfen.

Drängender jedoch wurde nun der Krieg um den Besitz Kretas. Die Osmanen verstärkten ihre Bemühungen, und Giustinian versuchte am Pariser Hof alles, um Hilfstruppen zu erhalten. Doch dort war man mit dem Kampf um Flandern beschäftigt. Im Januar 1667 schreibt Giustinian daher resigniert: „Più facilmente il re spedirà venticinque mille huomini in Fiandra, che cinquecento a Candia“, der König schicke leichter 25.000 Mann nach Flandern, als 500 nach Candia. Der Krieg war weit entfernt und veraltet.

Doch nun wendete sich überraschend das Blatt. Der Devolutionskrieg wurde nach dem Abschluss des Friedens von Breda zwischen England und Holland beendet. König Ludwig begann, den Mittelmeerraum mit anderen Augen zu sehen, und Ende April 1668 konnte Giustinian die Entsendung der französischen Armee erwirken. Es gelang ihm, die Entsendung des Militärexperten A. Dupuy de Montbrun zu erwirken. In Candia traf am 21. November 1668 das französische Expeditionskorps unter der Führung von La Feuillade ein. Die Erfolge der Venezianer bei Candia hatten in Paris eine Euphorie ausgelöst. Trotz dieses diplomatischen Erfolges gelang es Giustinian weder, seine Amtszeit in Paris zu verlängern, noch Zugang zum Collegio zu erhalten.

Weitere Magistraturen (ab 1670), im inneren Zirkel (ab 1678)

So kehrte er wieder in die ihm bereits bekannten Finanzmagistraturen zurück. So wurde er am 4. Oktober 1670 Inquisitore sopra i Dazi – Kreta war inzwischen verloren – dann am 14. Januar 1671 Deputato all'Affrancazione dei prò in Zecca, schließlich am 18. Mai Sindaco inquisitore in Terraferma. Bei letzterem Posten war er einer von drei Adligen, die die Aufgabe hatten, die Verwaltungstätigkeit anderer Magistrate zu überprüfen. Mit seinen Amtskollegen Antonio Barbarigo (später ersetzt durch Girolamo Corner) und Michele Foscarini unterstützte und, wenn nötig, verurteilte er die Tätigkeit der wichtigsten Rektoren – eine äußerst strapaziöse und wohl auch frustrierende Aufgabe, die Giustinian von 1672 bis 1675 ausübte. So erkrankte er in Bergamo und Rovigo. Dennoch gelang es Giustinian immer noch nicht, in den inneren Kreis vorzustoßen.

Doch nun wurde er in den Rat der Zehn gewählt (Oktober 1678 bis September 1679), dann zum Consigliere ducale im Februar 1681. Dort übte er sein Amt bis Januar 1682 aus, um zugleich von August bis September 1681 Inquisitore di Stato zu sein. Correttore della Promissione ducale wurde er 1676, er befasste sich also mit der Überarbeitung des Amtseids, den jeder Doge zu leisten hatte, dann wurde er Provveditore sopra Monasteri von 1677 bis 1678 und erneut 1683. Damit überwachte er die Nonnenklöster. In diesen Positionen entglitt ihm wieder der Zugriff auf den innersten Machtzirkel, ebenso wie als Angehöriger des Collegio delle pompe (1677–1679 und 1683–1684), dann Revisore e regolatore dei Dazi (1679–1681 und 1682), Provveditore alle Miniere (1679–1680 und 1683–1684), Inquisitore all'Arsenale (1680) sowie Sopraprovveditore alla Sanità (1682–1683) oder Provveditore in Zecca (1683–1684).

Vor diesem Hintergrund war erkennbar, dass er zwar einerseits höchsten Anforderungen gewachsen war, aber auch die Einzelinstitutionen aus eigener Erfahrung kannte, doch kam seine Wahl gleich im ersten Wahlgang völlig überraschend.

Wahl zum Dogen (1684)

Nach diesem Wahltag, dem 26. Januar 1684, war er versucht, Mönch im Kloster San Giorgio zu werden, nahm jedoch das höchste Staatsamt schließlich an. Für ihn sprachen durchaus seine Verdienste, auch die seines Bruders Girolamo im Botschafterdienst, seine Fähigkeit, Begeisterung für den bevorstehenden Kampf gegen die Osmanen zu wecken, hinzu kam sein Eintreten für die antiosmanische Heilige Liga. Hinzu kam, dass sich die übrigen Großfamilien nicht auf einen gemeinsamen Kandidaten hatten einigen können.