Zweitklassigkeit und Abstieg (2007–2011)

2007 entschied sich der spanisch-costa-ricanische Trainer und Manager Juan Luis Hernández den Klub Orión FC, einen Klub mit einer großen Geschichte und Tradition, vor dem Vergessenwerden zu bewahren und belebte ihn wieder. Hernández kaufte dem Klub ein Franchise für die Liga de Ascenso-Segunda División (vom Klub AD Puntarenense Parrita), mit dem Ziel in die Primera División aufzusteigen.

Aufgrund sich nicht einstellender Beliebtheit bei der Bevölkerung wechselte Orión mehrmals seinen Sitz, so spielten sie unter anderem in Tibás, Cartago, Atenas, Orotina und Curridabat. Außerdem hatte der Klub mehrere Namenszusätze wie zum Beispiel Orión-Tibás und Orión-Periféricos.

In der Saison 2009/2010 belegte Orión FC den letzten Platz und stieg in die Primera División Aficionada, den Amateurfußball ab.

Zurück in der Erstklassigkeit und direkter Wiederabstieg (2011/12)

Als Brujas FC sich während der zweiten Hälfte der Saison 2010/11 in extremen finanziellen Schwierigkeiten befand und schließlich aufgelöst wurde, ergriff Juan Luis Hernández die Möglichkeit und schloss mit den Besitzern des Franchise einen Vertrag das Franchise mindestens 5 Jahre mit Orión zu nutzen. Des Weiteren einigte Hernández sich mit der Stadt Desamparados darauf die Heimspiele, wie zuvor Brujas, im Estadio Cuty Monge auszutragen. Außerdem übernimmt Orión die Jugendabteilungen und teile des Kaders von Brujas.

Um sich mit der Bevölkerung von Desamparados zu identifizieren gab Hernández dem Klub einen Namenszusatz, so das Orión unter dem Namen „Orión FC – Desamparados“ an den Start ging.

Nachdem die Oberbürgermeisterin von Desamparados, Maureen Fallas, juristisch durchsetzte Orión das Nutzungsrecht für das Estadio Hernán „Cuty“ Monge zu entziehen. Dies war ihr möglich, da das Stadion sich aufgrund des Arrests Minor Vargas’ in den USA nun wieder vollständig im Besitz der Stadt Desamparados befunden hatte – sah sich der Verein gezwungen ein neues Domizil für die Spielzeit Verano 2012 zu suchen. Der Verein trägt somit seit Januar 2012 die Heimspiele seiner Profimannschaft nun in Tarrazú, San José aus; die rund 900 Schüler umfassende Fußballschule des Vereins ist nach Hatillo 8 umgezogen.

Orión belegte nicht nur in den beiden Halbjahresspielzeiten, sondern auch in der Gesamttabelle den letzten Platz und musste somit in einem Relegationsspiel gegen den Vizemeister der zweiten Liga, AD Carmelita ein Relegationsspiel bestreiten. Orión verlor die Relegation und stieg somit in die Liga de Ascenso-Segunda División ab. Grund für die schlechte Rückrunde (8 Punkte in 20 Spielen) waren vor allem die schlechten mit dem ungewollten Umzug nach Tarrazú verbundenen Rahmenbedingungen und die finanziell angespannte Situation.

2. Liga 2012/2013 und Drittklassigkeit

In der Saison 2012/2013 spielte Orión FC, nun ohne den Namenszusatz „Desamparados“, wieder in der zweitklassigen Liga de Ascenso-Segunda División. Orión belegte den letzten Platz in der Gesamttabelle und stieg somit in die drittklassige Amateurliga Primera División Aficionada ab.

Seit der Saison 2013/14 bestreitet Orión FC seine Heimspiele in der dritten Spielklasse Nahe Cartago, wo auch eine Fußballschule betrieben wird.