Polymerase basic Protein 1
Andere Namen
  • Polymerase basic protein 1 (Influenzavirus A)
  • RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit

Vorhandene Strukturdaten: PDB 2ZNL, PDB 2ZTT, PDB 3A1G

Masse/Länge Primärstruktur 757 Aminosäuren, 86.576 Da
Bezeichner
Externe IDs
Enzymklassifikation
EC, Kategorie 2.7.7.48
Orthologe
Influenzavirus A/PuertoRico/8/1934 (H1N1) Influenzavirus A/California/07/2009 (H1N1)
Entrez 956534 23308122
UniProt P03431 C3W5X7
Refseq (Protein) NP_040985.1
PubMed-Suche 956534 23308122

PB1 ist eines der bis zu elf verschiedenen Proteine des Influenzavirus A (IAV).

Eigenschaften

PB1 ist ein internes Protein des IAV und kommt im Virion vor. Es ist eines der drei viralen Proteine des RNA-Polymerase-Komplexes neben PA und PB2. PB1 ist neben PB2 ein Polymeraseprotein mit basischem isoelektrischen Punkt, während PA einen sauren (aciden) isoelektrischen Punkt aufweist. Daher stammt die Abkürzung des Namens.

Gelegentlich wird aus einem zweiten offenen Leseraster ein nichtessentielles Protein PB1-F2 gebildet. Der RNA-Polymerase-Komplex ist im Replikationszyklus für die Replikation und die Transkription der viralen RNA zuständig. Die Transkription der viralen mRNA erfolgt durch den einzigartigen Mechanismus des Cap snatching. Die mit 5'-methylierten Cap-Strukturen modifizierten zellulären mRNA werden von PB2 an der 7-Methylguanosingruppe gebunden und anschließend 10 bis 13 Nukleotide nach der Cap-Struktur durch PA geschnitten. Die kurzen Cap-tragenden Fragmente werden von PB1 gebunden und im RNA-Polymerase-Komplex als Primer für die Transkription viraler RNA verwendet. Bei der Replikation initiiert PB1 die RNA-Synthese. PB1 ist phosphoryliert.

Anwendungen

PB1 wird als Target bei der Entwicklung von Arzneistoffen gegen IAV untersucht.

Einzelnachweise

  1. M. R. Hilleman: Realities and enigmas of human viral influenza: pathogenesis, epidemiology and control. In: Vaccine Band 20, 2002, Nr. 25–26, S. 3068–3087, PMID 12163258.
  2. R. P. Kamal, I. V. Alymova, I. A. York: Evolution and Virulence of Influenza A Virus Protein PB1-F2. In: International journal of molecular sciences. Band 19, Nummer 1, Dezember 2017, S. , doi:10.3390/ijms19010096, PMID 29286299, PMC 5796046 (freier Volltext).
  3. S. Massari, L. Goracci, J. Desantis, O. Tabarrini: Polymerase Acidic Protein-Basic Protein 1 (PA-PB1) Protein-Protein Interaction as a Target for Next-Generation Anti-influenza Therapeutics. In: Journal of medicinal chemistry. Band 59, Nummer 17, September 2016, S. 7699–7718, doi:10.1021/acs.jmedchem.5b01474, PMID 27046062.
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