1919–1945: Weimarer Republik und Kriegsjahre

1928 verlegte das Unternehmen seine Zentrale nach Berlin.

Vor dem Hintergrund stetig zurückgehender Marktanteile des Schienengüterverkehrs infolge staatlich festgesetzter Preise und der steigenden Attraktivität des Straßengüterverkehrs suchte die Deutsche Reichsbahn zu Beginn der 1930er Jahre nach Möglichkeiten, das Güterverkehrsgeschäft zu stabilisieren.

Nachdem die Reichsregierung nicht bereit war, die Frachttarife anzuheben, wurde die damals größte Spedition in Deutschland Ende Januar 1931 durch die Deutsche Reichsbahn, im Rahmen eines zunächst geheim gehaltenen Vertrages, übernommen. Eine Woche später, am 5. Februar 1931, schloss die Reichsbahn darüber hinaus einen – zunächst ebenfalls geheimen – Kooperationsvertrag mit dem Unternehmen ab. Im Rahmen dieses so genannten „Schenker-Vertrags“ erhielt die Spedition das exklusive Recht, den Straßen-Güterverkehr im Vor- und Nachlauf des Eisenbahntransportes zu organisieren. Dabei konnte Schenker dieses Recht vor Ort auch an andere Speditionen abtreten, soweit diese sich verpflichteten, keinen Güterfernverkehr zu betreiben und den Transport zu von der Bahn festgelegten Tarifen abzuwickeln.

Durch die Geheimhaltung sollte eine Erhöhung der durch die Reichsbahn zu zahlenden Reparationen vermieden werden. Während der Kauf bis 1937/1938 geheim blieb, wurde das Kooperationsabkommen zwei Wochen nach seinem Abschluss publik und entfachte vielfältige Kritik. So sahen die Spediteure ein „systematisches Abwürgen des gewerblichen Güterverkehrs“. Die Reichsbahn wurde darüber hinaus für den Abschluss eines derart umfassenden Geschäftes ohne Rücksprache mit der Reichsregierung kritisiert. Mit Abschluss des Bahnspeditionsvertrages am 6. Dezember 1931 wurde die Exklusivvereinbarung mit Schenker aufgehoben, wobei gleichzeitig der Reichsbahn die Möglichkeit eingeräumt wurde, ihre Frachttarife selbst festzulegen. 1933 erwies sich in der Nachbetrachtung der Kaufpreis für Schenker als viel zu hoch, nachdem bekannt wurde, dass die Gesellschaft kurz vor der Übernahme vor dem Bankrott stand.

Nachdem Schenker bereits 1932 zunächst die Aktien der Aachener Spedition- und Lagerhaus Aktiengesellschaft (SPELAG) übernommen hatte, ein unter der Leitung von Albert Schiffers im gesamten Rheinland und in den benachbarten Niederlande tätiges Speditionsunternehmen, fusionierten schließlich beide Unternehmen im Jahr 1936, wobei die SPELAG als GmbH weitergeführt wurde.

In den Kriegsjahren 1939–1945 war das Gesamtunternehmen als Teil der Deutschen Reichsbahn am Transport von beschlagnahmten Haushalten von jüdischen Opfern des Holocausts beteiligt. Wie eine neue Studie herausfand, organisierte Schenker für die „Reichsgruppe Industrie“ den Beutetransfer der europaweiten Plünderungen in den von der Nazi-Wehrmacht okkupierten Staaten nach Deutschland. Nach Entladung im Reichsgebiet transportierte Schenker auf dem Rückweg an die Front umfangreiche Waffenarsenale, um die deutsche Großraubwirtschaft im „Neuen Europa“ militärisch abzusichern. Die Erträge aus Hehlerei, Raub und Mordbeihilfe wurden von Berlin nie restituiert.

Wie stark die Firma an Arisierungen beteiligt war, ist umstritten. Eine klare Stellungnahme wie im Falle des Dorotheums ist bis jetzt nicht erfolgt.

1945–1990: Wiederaufbau

Mit dem Zweiten Weltkrieg und anschließenden Enteignungen war der Verlust zahlreicher Niederlassungen verbunden. Das Unternehmen blieb weiterhin im Besitz der Deutschen Reichsbahn, mit Übergang am 7. September 1949 zur Deutschen Bundesbahn. Nach dem Wiederaufbau des Unternehmens erfolgten die weitere Internationalisierung und die Intensivierung der Luftfracht. 1947 wurde ein Tochterunternehmen in den Vereinigten Staaten gegründet. Im Weiteren wurde die Geschäftstätigkeit auf den asiatischen Markt ausgedehnt und in Hongkong eine eigene Gesellschaft gegründet.

1991–2001: Übernahme durch Stinnes AG

Im Jahr 1991 wurden die Anteile der Deutschen Bundesbahn und damit die Aktienmehrheit durch die Stinnes AG übernommen. 1997 wurde die Schenker AG mit den Geschäftsbereichen „Schenker Logistics“, „Schenker International“ und „Schenker Eurocargo“ gegründet. Nach der Übernahme der schwedischen BTL AB, Göteborg im Jahr 1999 wurde in Schenker-BTL AG umfirmiert.

2002–heute: Wiedereingliederung in die Deutsche Bahn AG

2002 übernahm die Deutsche Bahn AG wiederum mehrheitlich die Stinnes AG. Im selben Jahr wurde die Schenker-BTL AG mit der Schenker International Deutschland GmbH zur Schenker Deutschland AG zusammengeführt. 2007/2010 agierte die österreichische Tochtergesellschaft als Kronzeuge im Fall der Spediteurs-Sammelladungs-Konferenz.

Im Jahr 2009 wurden die Transportgeschäftsfelder der Deutschen Bahn unter dem Dach der Schenker AG restrukturiert, wodurch das Geschäftsfeld „DB Schenker Logistics“ den Landverkehr (außer Schienenverkehr), die Luft- und Seefracht und die Kontraktlogistik übernahm und das Geschäftsfeld „DB Schenker Rail“ den Schienenverkehr kontrollierte.

Im Juli 2011 wurde bekannt, dass das Luftfrachtangebot von der Tochter Bax Global, das bislang mit 20 Flugzeugen in Nordamerika und Mexiko betrieben wird, eingestellt wird. Grund ist das schwache Wirtschaftswachstum, verbunden mit hohen Treibstoffpreisen. Zukünftig soll dieser Frachtanteil auf dem Landweg transportiert werden.

Mitte März 2015 trennte sich das Unternehmen überraschend und ohne Angabe von Gründen von seinem Vorstandsvorsitzenden Thomas Lieb. Laut Medienberichten soll er von Schmiergeld-Zahlungen an den russischen Zoll in Höhe von wenigstens fünf Millionen US-Dollar gewusst haben. Im Juli 2015 verhängte die Europäische Kommission eine Geldstrafe von 31,8 Millionen Euro gegen DB Schenker wegen Beteiligung des Unternehmens an einem Kartell für Ganzzugladungen in den Jahren 2004 bis 2012.

2016 wurde eine weitere Restrukturierung vorgenommen, bei der das ehemalige Geschäftsfeld „DB Schenker Rail“ von der Schenker AG getrennt und in „DB Cargo“ umfirmiert wurde. Das zweite Geschäftsfeld „DB Schenker Logistics“ ging somit komplett in der Schenker AG auf und wird seitdem nicht mehr separat aufgeführt.

DB Schenker kooperiert bereits in Schweden mit dem Paketdienstleister GLS, einer Tochter der britischen Royal Mail (Stand 2015). Ab 2016 plant Schenker genauso in Deutschland das Paketgeschäft als wachsenden Bereich im Speditionsmarkt zu bedienen. Das Angebot soll sich an Firmenkunden als Versender richten, Schenker transportiert für GLS Stückgut auf Paletten, GLS stellt die Pakete den Empfängern zu.

Im Oktober 2018 integrierte DB Schenker das Navigations- und Adresssystem what3words in seine Dienstleistungen.

In einem Pilotprojekt in Schweden setzt DB Schenker seit 2019 den autonom fahrenden, vollelektrischen Lkw T-pod des Kooperationsunternehmens Einride ein.

Im Jahr 2021 stellte DB Schenker gemeinsam mit dem Flugtaxi-Hersteller Volocopter eine Schwerlastdrohne mit einer Tragfähigkeit von 200 kg vor. Im selben Jahr gründete das Unternehmen seinen Investitionsarm Schenker Ventures, um mit strategischen Investitionen Logistik-Startups zu fördern. 2022 investierte Schenker Ventures in Warehousing1, ein Berliner Startup für E-Commerce-Logistik.

Ende Juni 2022 wurde bekannt, dass DB Schenker den amerikanischen Logistiker USA Truck für 435 Millionen US-Dollar übernimmt und damit eine führende Position in Nordamerika einnimmt.

Die deutsche Bundesregierung beschloss, einen Verkauf von DB Schenker ab 2024 zu prüfen. Durch Beschluss des Aufsichtsrats der DB AG am 15. Dezember 2022 wurde der Vorstand der DB AG mandatiert, einen Verkauf zu prüfen und vorzubereiten. Grund dafür sei die verstärkte Verschuldung des Mutterkonzerns Deutsche Bahn AG. Der Erlös soll nach Meinung zahlreicher Verbände vollständig für den Ausbau der Infrastruktur in Deutschland verwendet werden.