Japan Football League 1999

Die Japan Football League 1999 war die erste Spielzeit der japanischen Japan Football League, eine in diesem Jahr neugegründete Spielklasse auf der dritten Stufe der japanischen Fußball-Ligenpyramide. Sie ist nicht zu verwechseln mit der vorher bestehenden Spielklasse gleichen Namens, die am Ende der Saison 1998 aufgelöst und deren Vereine anschließend auf die J. League Division 2 und diese Spielklasse aufgeteilt wurden.

An der Japan Football League 1999 nahmen neun Vereine teil. Die Saison begann am 18. April und endete am 7. November 1999. Der erst zu Beginn dieses Jahres als inoffizieller Nachfolger der Yokohama Flügels neugegründete Verein Yokohama FC errang die erste Meisterschaft der neuen Liga, der Drittplatzierte Mito HollyHock wurde nach Ende der Saison in die J. League Division 2 2000 aufgenommen.