Handball-FDGB-Pokal 1988/89

Der Handball-FDGB-Pokal der Herren wurde mit der Saison 1988/89 zum 19. Mal ausgetragen. Der SC Empor Rostock verteidigte seinen Titel aus dem Vorjahr und errang seinen fünften Pokalgewinn in Folge. Rostock, dass die beständigste Mannschaft der Endrunde stellte, ließ nur gegen den Zweiten Dynamo Berlin einen Punkt liegen und sicherten sich die Teilnahme am Europapokal der Pokalsieger.