Handball-Landesliga Bayern 1998/99
| Handball-Landesliga Bayern | |||
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| Meister: | Nord: BSV 1898 Bayreuth Süd: TSV Landsberg | ||
| Aufsteiger: | TSV Landsberg BSV 1898 Bayreuth VfB Forchheim | ||
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Die Handball-Landesliga Bayern 1998/99 wurde unter dem Dach des „Bayerischen Handballverbandes“ (BHV) organisiert und war hinter der Bayernliga als fünfthöchste Liga im deutschen Ligensystem eingestuft.