Long Terminal Repeat

Ein LTR (long terminal repeat) ist eine 200-3000 bp lange DNA-Wiederholungseinheit, die LTR-Elemente genannte Gene oder Pseudogene zu beiden Seiten flankieren und diese nach dem Herausschneiden zur Reintegration ins Genom befähigen (Transposition). Das Phänomen findet sich bei Retrotransposons, bei Endogenen Retroviren und bei retroviralen Proviren. Dabei wird bei allen Retroviren das Genom gewöhnlich von LTRs flankiert, die die spätere Integration zum Provirus vermitteln, es gibt aber auch einige Retrotransposons ohne LTRs.

Typischerweise kodiert ein Element, das von einem LTR-Paar flankiert wird, eine Reverse Transkriptase und eine Integrase, wodurch das Element kopiert und an einer anderen Stelle des Genoms eingefügt werden kann. Kopien eines solchen LTR-flankierten Elements können oft hunderte oder tausende Male in einem Genom gefunden werden. LTR-Retrotransposons machen etwa 8 % des menschlichen Genoms aus.

↑ Beatrice Weber, Tony Heitkam, Daniela Holtgräwe, Bernd Weisshaar, André E. Minoche: Highly diverse chromoviruses of Beta vulgaris are classified by chromodomains and chromosomal integration. In: Mobile DNA. Band 4, Nr. 1, 1. März 2013, ISSN 1759-8753, S. 8, doi:10.1186/1759-8753-4-8 (englisch).
↑ M. Zaratiegui: Influence of long terminal repeat retrotransposons in the genomes of fission yeasts. In: Biochemical Society transactions. Band 41, Nr. 6, Dezember 2013, S. 1629–1633, ISSN 1470-8752, doi:10.1042/BST20130207, PMID 24256266.
1 2 Charles A. Ishak, Daniel D. De Carvalho: Reactivation of Endogenous Retroelements in Cancer Development and Therapy. In: Annual Review of Cancer Biology. 4. Jahrgang, 2020, S. 159–176, doi:10.1146/annurev-cancerbio-030419-033525 (englisch).

[1] Beatrice Weber, Tony Heitkam, Daniela Holtgräwe, Bernd Weisshaar, André E. Minoche: Highly diverse chromoviruses of Beta vulgaris are classified by chromodomains and chromosomal integration. In: Mobile DNA. Band 4, Nr. 1, 1. März 2013, ISSN 1759-8753, S. 8, doi:10.1186/1759-8753-4-8 (englisch).

[2] M. Zaratiegui: Influence of long terminal repeat retrotransposons in the genomes of fission yeasts. In: Biochemical Society transactions. Band 41, Nr. 6, Dezember 2013, S. 1629–1633, ISSN 1470-8752, doi:10.1042/BST20130207, PMID 24256266.

[Ishak2020-3] 1 2 Charles A. Ishak, Daniel D. De Carvalho: Reactivation of Endogenous Retroelements in Cancer Development and Therapy. In: Annual Review of Cancer Biology. 4. Jahrgang, 2020, S. 159–176, doi:10.1146/annurev-cancerbio-030419-033525 (englisch).