Meistriliiga 1999
| Meistriliiga 1999 | |
| Meister | FC Levadia Maardu |
| Champions-League- Qualifikation | FC Levadia Maardu |
| UEFA-Pokal- Qualifikation | JK Tulevik Viljandi FC Flora Tallinn |
| UI-Cup | JK Trans Narva |
| Pokalsieger | FC Levadia Maardu |
| Relegation ↓ | Lelle SK |
| Absteiger | JK Eesti Põlevkivi Jõhvi |
| Mannschaften | 8 |
| Spiele | 112 + 2 Relegationsspiele (davon 2 strafverifiziert) |
| Tore | 324 (ø 2,95 pro Spiel) (ohne strafverifizierte Spiele) |
| Torschützenkönig | Toomas Krõm (FC Levadia Maardu) |
| ← Meistriliiga 1998 | |
Esiliiga 1999 (II) ↓ | |
Die Meistriliiga 1999 war die neunte Spielzeit der höchsten estnischen Fußball-Spielklasse der Herren, der Meistriliiga. Gespielt wurde regulär vom 14. April bis zum 27. Oktober 1999, die beiden Relegationsspiele fanden am 6. und 14. November 1999 statt.