Schrotschuss-Sequenzierung

Schrotschuss-Sequenzierung bzw. Shotgun Sequencing ist in der Molekularbiologie eine Methode zur Sequenzierung langer DNA-Stränge. Sie wurde von 1979 bis 1981 entwickelt. Hierbei wird die DNA zunächst zufällig fragmentiert und die resultierenden Fragmente anschließend sequenziert (einige Sequenzierverfahren beinhalten zusätzlich einen Schritt, in dem die DNA vor der Sequenzierung vervielfältigt wird). Unter Anwendung bioinformatischer Methoden wird aus den Fragmenten anschließend die zugrundeliegende DNA-Sequenz rekonstruiert, wobei ein Minimum an Fehlern und Lücken in der Sequenz angestrebt wird.

↑ R. Staden: A strategy of DNA sequencing employing computer programs. In: Nucleic Acids Research (1979), Band 6, Heft 7, S. 2601–2610, doi:10.1093/nar/6.7.2601, PMID 461197, PMC 327874 (freier Volltext).
↑ S. Anderson: Shotgun DNA sequencing using cloned DNase I-generated fragments. In: Nucleic Acids Research (1981), Band 9, Heft 13, S. 3015–3027, doi:10.1093/nar/9.13.3015, PMID 6269069, PMC 327328 (freier Volltext).

[1] R. Staden: A strategy of DNA sequencing employing computer programs. In: Nucleic Acids Research (1979), Band 6, Heft 7, S. 2601–2610, doi:10.1093/nar/6.7.2601, PMID 461197, PMC 327874 (freier Volltext).

[2] S. Anderson: Shotgun DNA sequencing using cloned DNase I-generated fragments. In: Nucleic Acids Research (1981), Band 9, Heft 13, S. 3015–3027, doi:10.1093/nar/9.13.3015, PMID 6269069, PMC 327328 (freier Volltext).