Bonnie Berger

Bonnie Anne Berger ist eine amerikanische Mathematikerin und Informatikerin. Sie ist Professorin für Mathematik und Professorin für Elektrotechnik und Informatik am Massachusetts Institute of Technology. Ihre Forschungsinteressen liegen in den Bereichen Algorithmen, Bioinformatik und computergestützte Molekularbiologie.

Studium

Berger absolvierte ihr Studium an der Brandeis University und promovierte 1990 am MIT unter der Leitung von Silvio Micali. Als Studentin gewann sie 1989 den Machtey Award für eine Arbeit über parallele Algorithmen, die sie zusammen mit ihrem Kommilitonen John Rompel auf dem Symposium on Foundations of Computer Science veröffentlichte.

Karriere und Forschung

Nach Abschluss ihrer Promotion blieb Berger als Postdoc am MIT, wo sie 1992 Mitglied der Fakultät wurde. Ihre Forschungsarbeiten im Bereich der Bioinformatik wurden in Fachzeitschriften veröffentlicht, darunter Science und Journal of Algorithms.

Berger war Vizepräsidentin der International Society for Computational Biology (ISCB) und Vorsitzende des Lenkungsausschusses für RECOMB-Konferenzen über computergestützte Molekularbiologie.

Preise und Auszeichnungen

1997: Margaret Oakley Dayhoff Award
1998: eingeladene Rednerin auf dem Internationalen Mathematikerkongress in Berlin (konnte aber nicht persönlich erscheinen)
1999: Aufnahme in die Liste der 100 wichtigsten Innovatoren von Technology Review
2003: Fellow der Association for Computing Machinery (ACM)
2012: Mitglied der American Academy of Arts and Sciences
2012: Fellow der International Society for Computational Biology (ISCB)
2015: Ehrendoktorwürde der École polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL)
2016: Aufnahme in das College of Fellows des American Institute for Medical and Biological Engineering (AIMBE)
2019: Fellow der American Mathematical Society für Beiträge zur Computerbiologie, Bioinformatik, Algorithmen und für Mentoring
stellvertretende Mitgliedschaft der Sektion Mathematik der American Association for the Advancement of Science (AAAS).
2019: Senior Scientist Award der International Society for Computational Biology (ISCB)
2020: Lecture Award der AWM-SIAM Sonia Kovalevsky
2020: Aufnahme in die National Academy of Sciences
2022: Fellowship der Society for Industrial and Applied Mathematics für Pionierarbeit in der computergestützten Molekularbiologie, einschließlich vergleichender und komprimierender Genomik, Netzwerkinferenz, genomischer Privatsphäre und Proteinstrukturvorhersage

Weblinks

Commons: Bonnie Berger – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien

Einzelnachweise

1 2 3 Profile. In: math.mit.edu. Massachusetts Institute of Technology, Department of Mathematics, abgerufen am 11. April 2023 (englisch).
↑ Bonnie Berger - MIT Mathematics. In: math.mit.edu. Abgerufen im 1. Januar 1 (englisch).
↑ Bonnie Berger im Mathematics Genealogy Project (englisch)
↑ C. N. Fogg, R. Shamir, D. E. Kovats: Bonnie Berger - Awards. In: Bioinformatics. 36. Jahrgang, Nr. 20, 2020, S. 5122–5123, doi:10.1093/bioinformatics/btz389, PMID 33351928, PMC 7755407 (freier Volltext) – (englisch).
↑ S. Roy, J. Ernst, P. V. Kharchenko, P. Kheradpour, N. Negre, M. L. Eaton, J. M. Landolin, C. A. Bristow, L. Ma, M. F. Lin, S. Washietl, B. I. Arshinoff, F. Ay, P. E. Meyer, N. Robine, N. L. Washington, L. Di Stefano, E. Berezikov, C. D. Brown, R. Candeias, J. W. Carlson, A. Carr, I. Jungreis, D. Marbach, R. Sealfon, M. Y. Tolstorukov, S. Will, A. A. Alekseyenko, C. Artieri, B. W. Booth, A. N. Brooks: Identification of Functional Elements and Regulatory Circuits by Drosophila modENCODE. In: Science. 330. Jahrgang, Nr. 6012, 2010, ISSN 0036-8075, S. 1787–1797, doi:10.1126/science.1198374, PMID 21177974, PMC 3192495 (freier Volltext), bibcode:2010Sci...330.1787R (englisch).
↑ Bonnie Berger: Tight Bounds for the Maximum Acyclic Subgraph Problem. In: Journal of Algorithms. 25. Jahrgang, 1992, S. 1–18, doi:10.1006/jagm.1997.0864 (englisch).
↑ Aug 18, 2014 - ISCB Announces Results of the 2014 Officer Elections. ISCB, abgerufen am 17. Januar 2015 (englisch).
↑ History of RECOMB. Abgerufen am 11. April 2023 (englisch).
↑ Bonnie Berger: ACM Fellow. In: awards.acm.org. Abgerufen im 1. Januar 1 (englisch).
↑ Berger Named ISCB Fellow - MIT CSAIL. Abgerufen am 17. Januar 2015 (englisch).
↑ Mediacom: Une Magistrale diversité. 10. März 2015 (epfl.ch [abgerufen am 11. April 2023]).
↑ Bonnie Berger to be Inducted into Medical and Biological Engineering Elite. AIMBE, abgerufen am 6. März 2016 (englisch).
↑ Sonia Kovalevsky Lectures. Abgerufen im 1. Januar 1 (englisch).
↑ 2020 NAS Election. In: www.nasonline.org. Abgerufen am 17. Juni 2020 (englisch).
↑ SIAM Announces Class of 2022 Fellows. In: SIAM News. 31. März 2022, abgerufen am 31. März 2022 (englisch).

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[:0-1] 1 2 3 Profile. In: math.mit.edu. Massachusetts Institute of Technology, Department of Mathematics, abgerufen am 11. April 2023 (englisch).

[profile-2] Bonnie Berger - MIT Mathematics. In: math.mit.edu. Abgerufen im 1. Januar 1 (englisch).

[mathgene-3] Bonnie Berger im Mathematics Genealogy Project (englisch)

[education-4] C. N. Fogg, R. Shamir, D. E. Kovats: Bonnie Berger - Awards. In: Bioinformatics. 36. Jahrgang, Nr. 20, 2020, S. 5122–5123, doi:10.1093/bioinformatics/btz389, PMID 33351928, PMC 7755407 (freier Volltext) – (englisch).

[RoyErnst2010-5] S. Roy, J. Ernst, P. V. Kharchenko, P. Kheradpour, N. Negre, M. L. Eaton, J. M. Landolin, C. A. Bristow, L. Ma, M. F. Lin, S. Washietl, B. I. Arshinoff, F. Ay, P. E. Meyer, N. Robine, N. L. Washington, L. Di Stefano, E. Berezikov, C. D. Brown, R. Candeias, J. W. Carlson, A. Carr, I. Jungreis, D. Marbach, R. Sealfon, M. Y. Tolstorukov, S. Will, A. A. Alekseyenko, C. Artieri, B. W. Booth, A. N. Brooks: Identification of Functional Elements and Regulatory Circuits by Drosophila modENCODE. In: Science. 330. Jahrgang, Nr. 6012, 2010, ISSN 0036-8075, S. 1787–1797, doi:10.1126/science.1198374, PMID 21177974, PMC 3192495 (freier Volltext), bibcode:2010Sci...330.1787R (englisch).

[6] Bonnie Berger: Tight Bounds for the Maximum Acyclic Subgraph Problem. In: Journal of Algorithms. 25. Jahrgang, 1992, S. 1–18, doi:10.1006/jagm.1997.0864 (englisch).

[iscb-vp-7] Aug 18, 2014 - ISCB Announces Results of the 2014 Officer Elections. ISCB, abgerufen am 17. Januar 2015 (englisch).

[8] History of RECOMB. Abgerufen am 11. April 2023 (englisch).

[9] Bonnie Berger: ACM Fellow. In: awards.acm.org. Abgerufen im 1. Januar 1 (englisch).

[iscb-fellow-10] Berger Named ISCB Fellow - MIT CSAIL. Abgerufen am 17. Januar 2015 (englisch).

[11] Mediacom: Une Magistrale diversité. 10. März 2015 (epfl.ch [abgerufen am 11. April 2023]).

[aimbe-12] Bonnie Berger to be Inducted into Medical and Biological Engineering Elite. AIMBE, abgerufen am 6. März 2016 (englisch).

[13] Sonia Kovalevsky Lectures. Abgerufen im 1. Januar 1 (englisch).

[14] 2020 NAS Election. In: www.nasonline.org. Abgerufen am 17. Juni 2020 (englisch).

[15] SIAM Announces Class of 2022 Fellows. In: SIAM News. 31. März 2022, abgerufen am 31. März 2022 (englisch).