Muhammad Schabir (arabisch محمد شبير; * 1946 in Chan Junis im Gazastreifen) ist ein palästinensischer Wissenschaftler und war im November 2006 Kandidat für das Amt des Ministerpräsidenten der Palästinensischen Autonomiegebiete.
Schabirs Vater war eines der führenden Mitglieder der Moslembrüder im Gazastreifen. Schabir selbst studierte in Alexandria und an der West Virginia University in den USA, wo er in der Mikrobiologie promovierte. 1990 wurde er Präsident der Islamischen Universität in Gaza und bekleidete dieses Amt bis zu seinem Rücktritt 2005.
Schabir steht der Hamas nahe, ohne aber offiziell Mitglied zu sein. Er unterhält jedoch auch zur Fatah-Bewegung gute Beziehungen. Daher wurde er von der Hamas als Nachfolger Ismail Haniyyas ins Gespräch gebracht. Aufgrund der allgemeinen politischen Lage zerschlugen sich aber diese Absichten. Über seine politischen Ansichten ist wenig bekannt, da er sich dazu so gut wie noch nie geäußert hat.
Schabir ist verheiratet und hat sechs Kinder. Seine Frau ist stellvertretende Ministerin für Frauen in der gegenwärtigen Hamas-Regierung.