Strukturformel | |||||||||||||
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Allgemeines | |||||||||||||
Name | N2,N2-Dimethylguanosin | ||||||||||||
Andere Namen |
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Summenformel | C12H17N5O5 | ||||||||||||
Externe Identifikatoren/Datenbanken | |||||||||||||
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Eigenschaften | |||||||||||||
Molare Masse | 311,29 g·mol−1 | ||||||||||||
Aggregatzustand |
fest | ||||||||||||
Schmelzpunkt |
235–236 °C | ||||||||||||
Sicherheitshinweise | |||||||||||||
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Soweit möglich und gebräuchlich, werden SI-Einheiten verwendet. Wenn nicht anders vermerkt, gelten die angegebenen Daten bei Standardbedingungen. |
N2,N2-Dimethylguanosin (m22G) ist ein seltenes Nukleosid und kommt in der tRNA und rRNA vor. Es besteht aus der β-D-Ribofuranose (Zucker) und dem N2,N2-Dimethylguanin. Es ist ein Derivat des Guanosins, welches an der Aminogruppe zweifach methyliert ist.
Weitere dimethylierte Nukleinbasen sind N4,N4-Dimethylcytidin und N6,N6-Dimethyladenosin.
Eigenschaften
Es sitzt beispielsweise in der tRNAAla und tRNATyr – meistens an Position 26 – als „Scharnier“ zwischen dem Dihydrouracil-Arm und dem Anticodon-Arm. Die Modifizierung des Guanins erfolgt durch N2,N2-Dimethylguanosin-tRNA-methyltransferasen (EC 2.1.1.213, EC 2.1.1.215, EC 2.1.1.216). Die Methylgruppe wird durch S-Adenosylmethionin bereitgestellt.
Aufgrund der zweifachen Methylierung in der 2-Position ist eine Basenpaarung mit Cytosin nicht möglich. Allerdings ist eine Paarung mit dem gegenüberliegenden Adenin in der Position 44 möglich.
N2,N2-Dimethylguanosin wird im Gegensatz zu anderen Nukleosiden nicht zu Harnsäure abgebaut, sondern unverändert mit dem Urin ausgeschieden.
Weblinks
- Eintrag zu N2,N2-Dimethylguanosine in der Human Metabolome Database (HMDB), abgerufen am 12. Oktober 2013.
- Modification Summary von N2,N2-dimethylguanosine in der Modomics-Datenbank, abgerufen am 14. Januar 2014.
Einzelnachweise
- ↑ Eintrag zu N2,N2-Dimethylguanosine in der Human Metabolome Database (HMDB), abgerufen am 12. Oktober 2013.
- ↑ Dieser Stoff wurde in Bezug auf seine Gefährlichkeit entweder noch nicht eingestuft oder eine verlässliche und zitierfähige Quelle hierzu wurde noch nicht gefunden.
- ↑ Patrick A. Limbach, Pamela F. Crain, James A. McCloskey: „Summary: the modified nucleosides of RNA“, Nucleic Acids Research, 1994, 22 (12), S. 2183–2196 (doi:10.1093/nar/22.12.2183, PMC 523672 (freier Volltext), PMID 7518580).
- ↑ Robert W. Holley, Jean Apgar, George A. Everett, James T. Madison, Mark Marquisee, Susan H. Merrill, John Robert Penswick, Ada Zamir: „Structure of a Ribonucleic Acid“, Science, 1965, 147, S. 1462–1465 (doi:10.1126/science.147.3664.1462).
- ↑ Robert W. Holley: „The Nucleotide Sequence of a Nucleic Acid“, Scientific American, Februar 1966, 214, S. 30–39.
- ↑ B. P. Doctor, Judith E. Loebel, Mary Ann Sodd, David B. Winter: „Nucleotide Sequence of Escherichia coli Tyrosine Transfer Ribonucleic Acid“, Science, 1969, 163, S. 693–695 (doi:10.1126/science.163.3868.693).
- ↑ J. Edqvist, H. Grosjean, K. B. Stråby: „Identity elements for N2-dimethylation of guanosine-26 in yeast tRNAs“, Nucleic Acids Res., 1992, 20 (24), S. 6575–6581 (PMC 334573 (freier Volltext); PMID 1480477).
- ↑
- ↑ Awai, T., Kimura, S., Tomikawa, C., Ochi, A., Ihsanawati, Bessho, Y., Yokoyama, S., Ohno, S., Nishikawa, K., Yokogawa, T., Suzuki, T., Hori, H.: Aquifex aeolicus tRNA (N2,N2-guanine)-dimethyltransferase (Trm1) catalyzes transfer of methyl groups not only to guanine 26 but also to guanine 27 in tRNA. In: J. Biol. Chem. 284. Jahrgang, 2009, S. 20467–20478, PMID 19491098.
- ↑ Constantinesco, F., Motorin, Y., Grosjean, H.: Characterisation and enzymatic properties of tRNA(guanine26, N2,N2-dimethyltransferase (Trm1p) from Pyrococcus furiosus. In: J. Mol. Biol. 291. Jahrgang, 1999, S. 375–392, PMID 10438627.
- ↑ Constantinesco, F., Benachenhou, N., Motorin, Y., Grosjean, H.: The tRNA(guanine-26,N2-N2) methyltransferase (Trm1) from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus furiosus: cloning, sequencing of the gene and its expression in Escherichia coli. In: Nucleic Acids Res. 26. Jahrgang, 1998, S. 3753–3761, PMID 9685492.
- ↑ Liu, J., Liu, J., Straby, K.B.: Point and deletion mutations eliminate one or both methyl group transfers catalysed by the yeast TRM1 encoded tRNA (m22G26)dimethyltransferase. In: Nucleic Acids Res. 26. Jahrgang, 1998, S. 5102–5108, PMID 9801306.
- ↑ Liu, J., Zhou, G.Q., Straby, K.B.: Caenorhabditis elegans ZC376.5 encodes a tRNA (m22G26)dimethyltransferance in which 246arginine is important for the enzyme activity. In: Gene. 226. Jahrgang, 1999, S. 73–81, PMID 10048958.
- ↑ Pradeep S. Pallan, Christoph Kreutz, Silvia Bosio, Ronald Micura, Martin Egli: „Effects of N2,N2-dimethylguanosine on RNA structure and stability: Crystal structure of an RNA duplex with tandem m22G:A pairs“, RNA, 2008, 14, S. 1–11 (doi:10.1261/rna.1078508; PDF).
- ↑ Rüdiger Hörbelt (Diss.): „Nachweis, Isolierung und Charakterisierung von N2,N2-Dimethylguanosin als inhibierenden Faktor der Ca2+-ATPase bei chronischer Niereninsuffizienz“, Ruhr-Universität, Bochum 1998 (PDF (Memento des vom 6. März 2016 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis. ; 332 kB).