Young Boys Bern, 1957–1961

In den drei Meisterschaftsrunden von 1957/58 bis 1959/60 gewann Allemann als Stürmer mit seinem Verein Young Boys Bern dreimal in Folge den Titel des schweizerischen Fussballmeisters. Im Jahre 1961 wurde er mit seiner Mannschaft Vizemeister. Der Pokalgewinn von 1958 gelang im Wiederholungsspiel gegen Grasshoppers Zürich. Das Spiel endete mit 4:1 Toren.

Im Europapokal der Runde 1958/59 konnte Allemann mit seiner Mannschaft bis in das Halbfinale vordringen. Überwunden wurden hierzu sowohl MTK Budapest wie auch Wismut Aue. Im Jahr danach scheiterte Bern im Europapokal am Deutschen Meister Eintracht Frankfurt. Im Wankdorfstadion wurde die überlegen spielende Eidgenossen-Elf in der zweiten Halbzeit durch die Riederwälder ausgekontert und verlor mit 1:4 Toren. Im Rückspiel in Frankfurt zeigte der Torhüter Walter Eich eine herausragende Leistung. Die Eintracht musste sich mit einem 1:1 begnügen.

Im Ausland (Mantova, Eindhoven und Nürnberg), 1961–1966

• Toni Allemann hatte mit seinen internationalen Auftritten die Verantwortlichen des italienischen Vereins AC Mantova in Mantua (Lombardei) auf sich aufmerksam gemacht. Für einen Vereinswechsel wurden ihm 70.000 Franken geboten. Allemann nahm das Angebot an und wechselte im Sommer 1961 nach Italien. Der AC Mantova war zur Saison 1961/62 in die Serie A des italienischen Fussballs aufgestiegen und bot somit auch eine sportliche Perspektive.
• Nach zwei Jahren beim AC Mantova spielte Allemann für eine Saison (1963/64) in den Niederlanden für die PSV Eindhoven.
• Anschliessend wechselte der dribbelstarke Linksaußen in die erst ein Jahr zuvor gegründete deutsche Bundesliga. 1964 verpflichtete der 1. FC Nürnberg den damals 28-jährigen Nationalspieler als Stürmer. Die Trainer des Vereins Gunther Baumann (in der Saison 1964/65) und Jenő Csaknády (in der Saison 1965/66) waren jedoch mit den Leistungen Allemanns nicht zufrieden. Daher verliess er Nürnberg bereits zum Ende der Saison 1966 wieder. In 50 Bundesligaspielen hatte er acht Tore erzielt.

Wieder in der Schweiz, 1966–1973

1966 kehrte Allemann in die Schweiz zum Grasshopper Club Zürich zurück. In seiner zweiten Saison (1967/68) verpasste er nach Entscheidungsspielen gegen den Lokalrivalen FC Zürich und den FC Lugano seinen vierten Meisterschaftsgewinn in der Schweiz. Die Entscheidungsspiele waren durch Punktgleichheit nötig geworden. Der inzwischen 32-Jährige wurde mit Grasshopper Club Zürich Vizemeister. Zum Ende der Saison 1967/68 verliess er den Grasshopper Club Zürich wieder. Er beendete – nachdem er zwischenzeitlich noch bei zwei weiteren Vereinen tätig war – beim seinerzeit in der zweithöchsten Schweizer Liga spielenden FC Schaffhausen als Spielertrainer seine Karriere zu Ende der Saison 1972/73 im Alter von 37 Jahren.