VOTCA
Basisdaten
Maintainer Victor Rühle, Christoph Junghans, Alexander Lukyanov, Kurt Kremer, Denis Andrienko
Entwickler Max-Planck-Institut für Polymerforschung
Los Alamos National Laboratory
Beckman Institute for Advanced Science and Technology
Technische Universität Eindhoven
Erscheinungsjahr 2008
Aktuelle Version 1.6.4
(12.01.2021)
Betriebssystem Linux, macOS, Windows, any other Unix variety
Programmiersprache C++, Perl, Bash
Kategorie Coarse-grained modeling
Lizenz Apache License 2.0
deutschsprachig nein
www.votca.org

Versatile Object-oriented Toolkit for Coarse-graining Applications (VOTCA) ist ein Softwarepaket zur coarse-grainted Modellierung, das sich auf die Analyse molekulardynamischen Daten und die Entwicklung von systematische coarse-graining Methoden sowie Methoden zur Simulation des mikroskopischen Ladungsträgertransport in ungeordneten Halbleitern konzentriert. Es wurde ursprünglich am Max-Planck-Institut für Polymerforschung entwickelt und wird jetzt von Entwicklern am Max-Planck-Institut für Polymerforschung, Los Alamos National Laboratory, der technischen Universität Eindhoven und dem Beckman Institute for Advanced Science and Technology sowie mit Beiträgen von Forschern weltweit weiterentwickelt.

Eigenschaften

VOTCA besteht aus drei Hauptteilen: dem Coarse-Graining-Toolkit (VOTCA-CSG), dem Ladungstransport-Toolkit (VOTCA-CTP) und dem Exzitontransport-Toolkit (VOTCA-XTP). Alle basieren auf der VOTCA-Tools Bibliothek, die gemeinsam genutzte Prozeduren implementiert.

Coarse-Graining-(VOTCA-CSG)

VOTCA-CSG unterstützt eine Vielzahl verschiedener Coarse-gaining Methoden, inkl. (iterativer) Boltzmann-Inversion, Inverse Monte Carlo, Force Matching und der Relative Entropie Methode und Methoden- und Hybridkombinationen dieser sowie optimierungsgesteuerte Ansätze wie Simplex und CMA. Um Statistiken zu sammeln, kann VOTCA-CSG mehrere Pakete wie GROMACS, DL_POLY, ESPResSo, ESPResSo ++, LAMMPS und HOOMD-blue für die Simulation verwenden.

Ladungstransport-Toolkit (VOTCA-CTP)

VOTCA-CTP ist ein Modul, das Berechnungen zur Überlappung von Molekülorbitalen durchführt und energetische Störungen und elektronische Kopplungen bewerten kann, die zur Abschätzung der Ladungstransporteigenschaften erforderlich sind.

Exzitontransport-Toolkit (VOTCA-XTP)

VOTCA-XTP ist eine Erweiterung von VOTCA-CTP, mit der Anregungstransporte und -eigenschaften simuliert werden können. Daher bietet es eine eigene Implementierung von GW - BSE und eine grundlegende DFT Implementierung unter Verwendung von lokalisierten Basissätzen. Polarisierte QM / MM-Berechnungen für angeregte Zustände werden im Thole-Framework bereitgestellt. Es bietet eine Schnittstelle zum Quantum Chemistry-Paket ORCA für große Produktionsläufe.

Release Names

Major Releases tragen Namen:

  • 1.1 SuperAnn
  • 1.2 SuperDoris
  • 1.3 SuperUzma
  • 1.4 SuperKurt - zur Feier von Kurt Kremer's 60th Geburtstag
  • 1.5 SuperVictor - Benannt nach Victor Rühle, einem der ehemaligenvHauptentwickler
  • 1.6 SuperPelagia
  • 1.6.2 SuperGitta

Siehe auch

Einzelnachweise

  1. ↑ VOTCA Development page
  2. ↑ VOTCA Releases von Github
  3. 1 2 Victor Rühle, Christoph Junghans, Alexander Lukyanov, Kurt Kremer and Denis Andrienko. "Versatile Object-oriented Toolkit for Coarse-graining Applications" Journal of Chemical Theory and Computation 5 (2009): 3201. doi:10.1021/ct900369w
  4. ↑ S. Y. Mashayak, Mara N. Jochum, Konstantin Koschke, N. R. Aluru, Victor Rühle, Christoph Junghans: Relative Entropy and Optimization-Driven Coarse-Graining Methods in VOTCA. In: PLOS ONE. 10. Jahrgang, Nr. 7, 20. Juli 2015, ISSN 1932-6203, S. e0131754, doi:10.1371/journal.pone.0131754, PMID 26192992, PMC 4507862 (freier Volltext).
  5. ↑ Victor Rühle, Alexander Lukyanov, Falk May, Manuel Schrader, Thorsten Vehoff, James Kirkpatrick, Bjoern Baumeier, Denis Andrienko . "Microscopic simulations of charge transport in disordered organic semiconductors" Journal of Chemical Theory and Computation, 7 (2011): 3335. doi:10.1021/ct200388s.
  6. ↑ Jens Wehner, Lothar Brombacher, Joshua Brown, Christoph Junghans, Onur Çaylak, Yuriy Khalak, Pranav Madhikar, Gianluca Tirimbò, and Björn Baumeier. "Electronic Excitations in Complex Molecular Environments: Many-Body Green's Functions Theory in VOTCA-XTP" Journal of Chemical Theory and Computation. doi:10.1021/acs.jctc.8b00617.
  7. ↑ https://groups.google.com/g/votca/c/XnzZRxvQMRA/m/N3Z0EYh9AQAJ
  8. ↑ https://groups.google.com/g/votca/c/W66eCZ1sn_s/m/tsk1kmp9DAAJ
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