Als Spieler

Als Trainer

Nach seinem Karriereende wurde Kafanow zur Saison 2000 in Russland beim Zweitligisten Kristall Smolensk Torwarttrainer von seinem Landsmann und ehemaligen Trainer bei Nisa, Gurban Berdiýew. Nach dessen Wechsel zu Rubin Kasan wurde Kafanow bis Saisonende interimistisch Cheftrainer des Zweitligisten. Unter seiner Führung holte Kristall fünf Siege in 15 Partien und beendete die Saison als Zehnter. Nach Saisonende folgte Kafanow zur Saison 2002 Berdiýew nach Kasan und wurde dort ebenfalls Torwarttrainer. In Kasan wurden die Turkmenen sowohl 2008 als auch 2009 Meister. Insgesamt stand Kafanow Berdiýew in über 470 Partien zur Seite, ehe das Trainerteam Kasan im Dezember 2013 verließ. Zwischen 2011 und 2012 war Kafanow zudem Torwarttrainer im russischen B-Nationalteam. Im Februar 2014 wurde er Torwarttrainer von Juri Krasnoschan im kasachischen Nationalteam. Diesen Posten hatte er bis zur Trennung von Kranoschan mit Jahresende 2015 inne.

Im Dezember 2014 wurde er zudem von Berdiýew zu dessen neuem Verein geholt, dem FK Rostow. Dort blieb er diesmal auch nach dem Rücktritt Berdiýews im August 2016. Nachdem Berdiýew allerdings im Juni 2017 ein zweites Mal Trainer in Kasan wurde verließ Kafanow Rostow ebenfalls und kehrte ebenfalls nach Kasan zurück. Im März 2019 wurde Kafanow wieder von Rostow abgeworben und dort als Co-Trainer von Waleri Karpin installiert. Nachdem Karpin im Juli 2021 als russischer Nationaltrainer präsentiert worden war, wurde er zusätzlich auch noch Torwarttrainer im Nationalteam Russlands. In Rostow blieb er auch unter Karpins Nachfolger Juri Sjomin Co. Nach dessen Rücktritt wurde er im Oktober 2021 Cheftrainer von Rostow. Nach sieben Partien im Amt, von denen Rostow eine gewann, wurde Kafanow im März 2022 wieder von Karpin abgelöst und erneut dessen Co-Trainer.