Xylencyanol ist eine chemische Verbindung aus der Gruppe der Triphenylmethanfarbstoffe.

Eigenschaften

Xylencyanol ist ein dunkelgrüner Feststoff. In verdünnter Lösung ist er aquamarinfarben, woher die Bezeichnung Xylencyanolblau stammt.

Verwendung

Xylencyanol wird als Farbstoff zur Markierung der Laufmittelfront bei einer Agarose- oder Polyacrylamid-Gelelektrophorese im Probenpuffer verwendet. Es hat zwei negative und eine positive Ladung und wandert aufgrund der negativen Nettoladung in die gleiche Richtung wie DNA, so dass die Wanderung der Moleküle durch das Gel überwacht werden kann. Einsatzkonzentrationen liegen meistens um die 0,01 bis 0,1 g/l. Die Wanderungsgeschwindigkeit variiert mit Gel-Zusammensetzung. In einem Agarosegel läuft es bei einprozentiger Agarosekonzentration (m/V) wie 4000 bis 5000 bp, bei zweiprozentiger Konzentration wie 800 bp. Bei sechsprozentigen Polyacrylamidgelen entspricht Xylencyanol 240 bp und in zehnprozentigen 120 bp. Die Verbindung bewegt sich aufgrund ihrer vier zusätzlichen Methylgruppen und der damit reduzierten Hydrophilität langsamer als das ebenfalls als Farbstoff verwendete Bromphenolblau und damit mit größeren DNA-Fragmenten.

Xylencyanol wird auch als Redox-Indikator bei der Titration von Arsen(III)-, Cer(IV)-, Eisen(II)-Verbindungen, sowie von Hexacyanoferrat(II) eingesetzt.

Einzelnachweise

1. 1 2 3 4 5 6 7 Datenblatt Xylene Cyanol FF, for molecular biology, BioReagent bei Sigma-Aldrich, abgerufen am 9. Dezember 2015 (PDF).
2. ↑ Datenblatt Xylencyanol bei Alfa Aesar, abgerufen am 9. Dezember 2015 (PDF) (JavaScript erforderlich).
3. 1 2 Lela Buckingham: Molecular Diagnostics. F.A. Davis, 2011, ISBN 978-0-803-62975-2. S. 98.
4. ↑ Budin Michov: Elektrophorese Theorie und Praxis. Walter de Gruyter, 1996, ISBN 978-3-11-081942-7, S. 339 (eingeschränkte Vorschau in der Google-Buchsuche). 
5. ↑ Paul Heinz List, Ludwig Hörhammer: Chemikalien und Drogen Teil C: T–Z. Springer-Verlag, 2013, ISBN 978-3-642-67085-5, S. 533 (eingeschränkte Vorschau in der Google-Buchsuche).