Fußball-Regionalliga Bayern 2012/13

Die Saison 2012/13 der Regionalliga Bayern war die fünfte Spielzeit der Fußball-Regionalliga als vierthöchste Spielklasse und die erste der Regionalliga Bayern in Deutschland. Durch eine Ligenreform gab es in der Saison 2012/13 nicht mehr drei Staffeln einer Regionalliga, sondern fünf gleichrangige Ligen von fünf Verbänden. Daher rührt auch die nun feste Ligazuteilung der Mannschaften je nach Verbandszugehörigkeit. Die Trägerschaft der Ligen ging vom DFB auf die Regional- und Landesverbände über. Die Vereine der Regionalliga erhielten keine Fernsehgelder mehr. Eine ursprünglich geplante Obergrenze von maximal sieben zweiten Mannschaften der DFL-Vereine wurde von den Landesverbänden verworfen. Zweite Mannschaften von Vereinen der 3. Liga dürfen maximal in der fünften Spielklasse (Oberliga) spielen, dritte Mannschaften besitzen generell kein Aufstiegsrecht zur Regionalliga.

Unter der Regionalliga wurde die Bayernliga auf zwei Staffeln erweitert.

Den Meistertitel sicherte sich die zweite Mannschaft des TSV 1860 München mit 80 Punkten und damit sieben Punkten Vorsprung auf die zweite Mannschaft des FC Bayern München. Den inoffiziellen Titel des Herbstmeisters hatte sich der FV Illertissen mit 38 Punkten gesichert. Durch den Meistertitel qualifizierten sich die Münchener für die Aufstiegsspiele zur 3. Liga, in denen sie in zwei Spielen am Südwest-Vertreter und -Vizemeister SV Elversberg scheiterten. Den Titel des Bayerischen Amateurmeisters für den bestplatzierten Verein, der keine zweite Mannschaft eines Profivereins war, errang der Drittplatzierte FV Illertissen, der sich damit gleichzeitig für die 1. Hauptrunde des DFB-Pokals der Saison 2013/14 qualifizierte.

Die Abstiegsränge belegten der SC Eltersdorf, der FC Ismaning und der VfL Frohnlach. Die zweite Mannschaft des FC Augsburg und die SpVgg Bayern Hof sicherten sich in den Relegationsrunde um den Verbleib in der Regionalliga mit den beiden Vertretern der Bayernliga nachträglich den Klassenerhalt.

Aus der Bayernliga stiegen der 1. FC Schweinfurt 05 als Meister der Staffel Nord und der SV Schalding-Heining als Meister der Staffel Süd auf. In der Relegationsrunde waren der TSV Großbardorf und der BC Aichach an den Regionalligisten gescheitert.