Aegiribacteria ist ein 2016 vorgeschlagener Kandidat für eine Gattung von Bak­terien. Sie wurde anhand von Genomsequenzen aus der Umwelt identifiziert (Metagenomik), und zwar aus Tiefensediment vom extrem meromiktischen Mahoney Lake in British Columbia (Kanada). Dieser See weist ungewöhnlich hohe Sulfat- und Sulfid­werte in der unteren Wassersäule (Hypolimnion) auf. Anhand dieser Analysen wurde festgestellt, dass die Organismen dieser Gattung wahrscheinlich einen fermentativen Stoffwechsel (Gärungs-Stoff­wech­sel) haben, und dass die vorgeschlagene Gattung zum Phylum (d. h. Stamm bzw. Abteilung, englisch division, lateinisch divisio) Fermentibacterota innerhalb der FCB-Gruppe gehört.

Systematik

Die hier angegebene Konsensus-Taxonomie der Gattung Aegiribacteria und ihrer (möglichen) näheren Verwandtschaft basiert mit Stand 9. März 2022 auf den folgenden Quellen:

• G – Genome Taxonomy database (GTDB)
• L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ)
• N – National Center for Biotechnology Information (NCBI, Taxonomy Browser)

Mit Fragezeichen versehene Einträge sind unsicher, mit Anführungszeichen veröffentlichte Namen sind nicht gültig veröffentlicht:

Klade (Superphylum): FCB-Gruppe (N)

• Phylum: Fermentibacterota (G), synonym "Candidatus Fermentibacteria" [phylum] Kirkegaard et al. 2016 (N), früher Candidate division Hyd24-12 (N)
  • Klasse: Fermentibacteria (G) bzw. Candidatus Fermentibacteria [class] (N)
    • Ordnung: Fermentibacterales (G)
      • Familie: Fermentibacteraceae (G)
        • Gattung: Aegiribacteria (G) alias „Candidatus Aegiribacteria“ Hamilton et al. 2016 (L,N)
          • Spezies: Aegiribacteria sp002030045 (G) alias Ca. Aegiribacteria sp. MLS_C (N,G)
          • Spezies: Aegiribacteria sp003644925 (G) alias Ca. Fermentibacteria bacterium B22_G4
          • Spezies: Aegiribacteria sp013138965 (G) alias Ca. Aegiribacteria sp. isolate GLR63 (G,N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate SMBSF04 (N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate SMBSF24 (N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate SMBSF55 (N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate RBin_049 (N)
      • ?Familie: „Fermentobadaceae“ Haiying 1995 (L)
        • Gattung: Guhaiyingella Haiying 1995 (L) mit Schreibvariante Guhaiyinggella Haiying 1995 (N mit abweichender Klassifizierung!)
          • Spezies Guhaiyingella guhaiyingii Haiying 1995 (L) mit Schreibvariante Guhaiyinggella guhaiyingii Haiying 1995 (N)
        • Gattung: „Candidatus Sabulitectum“ Saad et al. 2017 (N)
          • Spezies: „Candidatus Sabulitectum silens“ Saad et al. 2017 (N), inkl. Candidate division Hyd24-12 bacterium JCC-6 (N)

Anmerkungen:

1. NCBI klassifiziert die Gattung Guhaiyinggella in die Ordnung Enterobacterales der Klasse Gammaproteobacteria.
2. NCBI synonymisiert die Klasse „Paramycetes“ mit der Klasse Mollicutes unter dem Phylum Tenericutes.

Kladogramm

Anbei ein bezüglich 16S-rRNA Maximum-Likelihood-basierter phylogenetischer Baum der FCB-Gruppe (Fibrobacteres, Chlorobi, Bacteroidetes) inklusive MLS_C, vereinfacht nach Trinity Hamilton et al. (2016):

Etymologie

Der Begriff Aegiribacteria leitet sich von Ägir ab, einem nordischen Meeresgott. Dieser galt als berühmter Bierbrauer, was auf den vermuteten Gärungsstoffwechsel dieser Bakteriengruppe widerspiegelt.

Die für den provisorischen Artnamen benutzte Abkürzung MLS_C steht für Mahoney Lake Sediment C.

Literatur

• Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz: A proposal for a standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny. Auf: Biorxiv, Version 2, 31. Januar 2018. doi:10.1101/256800 (PrePrint).

Einzelnachweise

1. 1 2 3 NCBI: Candidatus Aegiribacteria, Details: "Candidatus Aegiribacteria" Hamilton et al. 2016 (genus); Candidatus Aegiribacteria, Lifemap NCBI Version.
2. 1 2 3 4 5 6 7 Aegiribacteria, Genome Taxonomy Database, Release 06-RS202 (27. April 2021). University of Queensland, Australia.
3. ↑ Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz: A standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny substantially revises the tree of life. In: Nature Biotechnology. Band 36, S. 996–1004, 27. August 2018; doi:10.1038/nbt.4229, PMID 30148503.
4. 1 2 3 Trinity L. Hamilton, Roderick J. Bovee, Sarah R. Sattin, Wiebke Mohr, William P. Gilhooly, Timothy W. Lyons, Ann Pearson, Jennifer L. Macalady: Carbon and sulfur cycling below the chemocline in a meromictic lake and the identification of a novel taxonomic lineage in the FCB superphylum, Candidatus Aegiribacteria. In: Frontiers in Microbiology. Band 7, S. 598, 27. April 2016; doi:10.3389/fmicb.2016.00598, PMC 4846661 (freier Volltext), PMID 27199928. Siehe insbes. Fig. 8: Maximum likelihood based phylogenetic 16S rRNA gene tree of members of the FCB superphylum and MLS_C.
5. 1 2 LPSN: "Candidatus Aegiribacteria" Hamilton et al. 2016 (Genus)
6. ↑ NCBI: Nucleotide: Fermentibacteria bacterium B22_G4
7. ↑ NCBI: MAG: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate GLR63, whole genome shotgun sequencing project
8. 1 2 3 4 5 NCBI: Nucleotide: txid2528271[Organism:noexp]
9. 1 2 NCBI: Guhaiyinggella, Details: "Guhaiyinggella" Haiying 1995 (genus); graphisch: Guhaiyinggella, Lifemap, NCBI Version.
10. 1 2 NCBI: Mollicutes, Details: Mollicutes Edward and Freundt 1967 (class, heterotypic synonym: "Paramycetes" Sabin 1941)