Die Autographiviridae (veraltet auch Autographivirinae, T7-Supergruppe, englisch T7 supergroup genannt) sind eine Familie von Viren in der Ordnung Caudovirales – sie wurden dort früher als Unterfamilie Autographivirinae in der früheren Familie Podoviridae geführt. Ihre natürlichen Wirte sind Bakterien. Es gibt derzeit 40 Arten (Spezies) in dieser Gruppe, die meisten davon sind einer von ca. sieben Gattungen zugewiesen.

Forschungsgeschichte

Seit den 1990er Jahren hat sich der Begriff T7-Supergruppe für die wachsende Gruppe der mit dem Coliphagen T7 verwandten Bakteriophagen vom Morphotyp der Podoviren etabliert. Salmonella virus SP6 (alias Enterobacteriaceae-Phage SP6) und Escherichia virus K1-5 (alias Enterobacteriaceae-Phage K1-5) wurden als erste als eine weitläufig verwandte Untergruppe (die heutige Gattung Zindervirus) dieser ‚T7-Supergruppe‘ betrachtet. Das Pseudomonas-Virus phiKMV (alias Bakteriophage phiKMV) zeigte auf der Ebene der Genomorganisation ebenfalls Gemeinsamkeiten. Basierend auf den verfügbaren morphologischen und proteomischen Daten wurde diese Virusklade zunächst als eine Unterfamilie in der damaligen Familie Podoviridae etabliert. Nachdem Genom-Untersuchungen gezeigt hatten. dass diese Familie nicht monophyletisch ist, wurde sie seitens des ICTV im März/April 2022 aufgelöst; die frühere Unterfamilie Aurographivirinae war schon vorher zur Familie Autographiviridae hochgestuft worden.

Etymologie

Der Name der Familie Autographiviridae kommt von griechisch αὐτο-γράφειν (aúto-gráphein, selbst-schreibend) und bezieht darauf, dass diese Phagen ihre eigene RNA-Polymerase kodieren, also selbst-transkribierend sind; dies ist ein gemeinsames Merkmal all ihrer Mitglieder.

Aufbau

Die Virusteilchen (Virionen) der Autographiviridae sind nicht umhüllt mit ikosaedrischem Kopf-Schwanz-Aufbau und eine Symmetrie (Triangulationszahl) T=7. Der Durchmesser beträgt ca. 60 nm. Das Genom ist linear und hat eine Länge von ca. 40–42 kb.

Vermehrungszyklus

Die Virusreplikation geschieht im Zytoplasma. Das Virus tritt durch Lyse (Auflösung) der Wirtszelle vermöge Holin-, Endolysin- bzw. Spanin-Proteinen aus dieser aus. Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.

Systematik

Die folgende Liste führt die Spezies in der Familie Autographiviridae auf gemäß der ICTV Master Species List (MSL) #37 v2:

Anmerkung: Die Cyanophagen vom Morphotyp der Myoviren werden in überkommener Weise in einer informellen Gattung Cyanopodovirus zusammengefasst. Viele deavon werden wegen genomischer Ähnlichkeit zu Escherichia-Virus T7 inzwischen zu den Autographiviridae, insbesondere der Unterfamilie Studiervirinae um T7 gestellt.

Weblinks

• Autographiviridae. Viralzone.
• ICTV.

Einzelnachweise

1. 1 2 3 ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
2. 1 2 ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
3. 1 2 3 Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 29. Dezember 2018. 
4. ↑ ICTV: Virus Taxonomy. Abgerufen am 29. Dezember 2018. 
5. ↑ D. Scholl, J. Kieleczawa, P. Kemp, J. Rush, C. C. Richardson, C. Merril, S. Adhya, I. J. Molineux: Genomic analysis of bacteriophages SP6 and K1-5, an estranged subgroup of the T7 supergroup. In: Journal of Molecular Biology. Band 335, Nr. 5, 2004, S. 1151–1171, doi:10.1016/j.jmb.2003.11.035, PMID 14729334. 
6. 1 2 Yunfen Hua, Tingting Luo, Yiqi Yang, Dong Dong, Rui Wang, Yanjun Wang, Mengsha Xu, Xiaokui Guo, Fupin Hu, Ping He: Phage Therapy as a Promising New Treatment for Lung Infection Caused by Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii in Mice, in: Front. Microbiol., 9. Januar 2018; doi:10.3389/fmicb.2017.02659
7. ↑ Natalia Bagińska, Anna Pichlak, Andrzej Górski1, Ewa Jończyk-Matysiak: Specific and Selective Bacteriophages in the Fight against Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii (PDF) in: Virologica Sinica, Band 34, S. 347–357; doi:10.1007/s12250-019-00125-0, Tbl. 1
8. 1 2 3 4 R. Abbasifar, A. M. Kropinski, P. M. Sabour, H. W. Ackermann, A. Alanis Villa, A. Abbasifar, M. W. Griffiths: The Genome of Cronobacter sakazakii Bacteriophage vB_CsaP_GAP227 Suggests a New Genus within the Autographivirinae. In: Genome Announc. Band 1, Nr. 1, 2013, doi:10.1128/genomeA.00122-12, PMID 23409275, PMC 3569369 (freier Volltext). 
9. 1 2 Mary Ann Liebert: New bacteriophage fully characterized and sequenced, auf: EurekAlert vom 27. Januar 2020, Quelle: Inc./Genetic Engineering News
10. ↑ NCBI: unclassified Teseptimavirus
11. ↑ NCBI: Phage PhiI (species)
12. ↑ NCBI: Serratia phage Pila (species)
13. 1 2 3 Sijun Huang et al.: Temporal transcriptomes of a marine cyanopodovirus and its Synechococcus host during infection, in: MicrobiologyOpen, 30. Dezember 2020, doi:10.1002/mbo3.1150
14. ↑ NCBI: Synechococcus phage S-SBP1 (species)
15. ↑ NCBI: Sednavirus SRIP2 (species)
16. ↑ John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned? In: Curr. Op. in Biotechnology, Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307, doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext), siehe Fig. 3 (Genomkarte)
17. ↑ NCBI: Prochlorococcus virus PSSP7 (species)
18. 1 2 Preeti Gipson, Matthew L. Baker, Desislava Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King, Wah Chiu: Protruding knob-like proteins violate local symmetries in an icosahedral marine virus. In: Nature Communications. 5. Jahrgang, Nr. 4278, 2. Juli 2014, doi:10.1038/ncomms5278 (englisch, nature.com). , Corrigendum, in: Nature Communications, Band 6, Nr. 6040, 12. Januar 2015, doi:10.1038/ncomms7040.
19. ↑ NCBI: Synechococcus virus P60 (species)
20. ↑ John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned?, Curr. Op. in Biotechnology Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307, doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext), siehe Fig. 1 (Genomkarte)
21. ↑ Jacqueline Z.-M. Chan, Andrew D. Millard, Nicholas H. Mann, Hendrik Schäfer: Comparative genomics defines the core genome of the growing N4-like phage genus and identifies N4-like Roseophage specific genes (PDF; 3,9 MB) In: Frontiers in Microbiology, Band 5, Nr. 506, 10. Oktober 2014, doi:10.3389/fmicb.2014.00506
22. ↑ NCBI: Synechococcus virus Syn5 (species)
23. ↑ Desislava A. Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King: Two Novel Proteins of Cyanophage Syn5 Compose Its Unusual Horn Structure. In: ASM Journal of Virology. 88. Jahrgang, Nr. 4, 15. Februar 2014, ISSN 0022-538X, S. 2047–2055, doi:10.1128/JVI.02479-13, PMID 24307583, PMC 3911526 (freier Volltext) – (englisch, jvi.asm.org (Memento des Originals vom 11. Mai 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 11. Mai 2021]).   Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/jvi.asm.org Epub 31. Januar 2014, insbes. Fig. 1 (Memento des Originals vom 11. Mai 2021 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/jvi.asm.org (mit B: Schemazeichnung)
24. ↑ Desislava A. Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King: Two Novel Proteins of Cyanophage Syn5 Compose Its Unusual Horn Structure, in: ASM Journals / Journal of Virology, Band 88, Nr. 4, 31. Januar 2014, doi:10.1128/JVI.02479-13
25. ↑ S. J. Labrie, K. Frois-Moniz, M. S. Osburne, L. Kelly, S. E. Roggensack, M. B. Sullivan, G. Gearin, Q. Zeng, M. Fitzgerald, M. R. Henn, S. W. Chisholm: Genomes of marine cyanopodoviruses reveal multiple origins of diversity. In: Environ. Microbiol. Band 15, Nr. 5, 2013, S. 1356–1376, doi:10.1111/1462-2920.12053, PMID 23320838 (mit.edu [PDF]). 
26. ↑ Stephen T. Abedon, Richard Calendar (Hrsg.): The Bacteriophages. 2. Auflage. Oxford University Press, 2005, ISBN 0-19-803385-0, S. 518f. (books.google.de)