„Hokovirus“
Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Varidnaviria
Reich: Bamfordvirae
Phylum: Nucleocytoviricota
Klasse: Megaviricetes
Ordnung: Imitervirales
Familie: Mimiviridae
Unterfamilie: Klosneuvirinae
Gattung: „Hokovirus“
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA
Baltimore: Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
„Hokovirus“
Kurzbezeichnung
HokV / HKV
Links
NCBI Taxonomy: 1977636 (Gattung),
1977638 (Spezies)

„Hokovirus“ (HokV) ist eine vorgeschlagene Gattung von Riesenviren im Phylum Nucleocytoviricota (früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV) aus der Familie Mimiviridae, Unterfamilie Klosneuvirinae, mit nur einer Spezies, „Hokovirus HKV1“.

HKV1 wurde bei der Analyse von Metagenomproben aus Bodensedimenten von Ablagerungen in der Kläranlage in Klosterneuburg nahe bei Wien, Österreich, gefunden.

Genom

Wie alle Riesenviren der NCLDV hat „Hokovirus HKV1“ ein Genom aus einer doppelsträngigen DNA (dsDNA). „Hokovirus ILV1“ hat ein großes Genom von 1.326.229 Basenpaaren (bp) und kodiert vorhergesagt 1.022 Proteine, das sind 881 Genfamilien. Damit hat „Hokovirus ILV1“ das drittgrößte Genom unter den zuerstidentifizierten Klosneuviren aus Klosterneuburg, nach „Klosneuvirus“ (1,57 Millionen bp, 1.272 Genfamilien) und „Catovirus“ (1,53 Millionen bp). Der GC-Gehalt beträgt 21,4 %, vergleichbar mit dem zweier anderer Riesenviren, Cafeteria-roenbergensis-Virus (CroV, Spezies Rheavirus sinusmexicani) und „Choanovirus 1“ (ChoanoV1), diese haben 23 % bzw. 22 %.

Wirte

Die Metagenomanalyse der ribosomalen 18S-rRNA zeigte weiter, dass ihre Wirte einfachen Cercozoa (zumindest) nahestehen.

Systematik

Zusammen mit Hokovirus wurden dort von Schulz et al. 2017 drei weitere Virusgattungen identifiziert, „Klosneuvirus“, „Catovirus“ und „Indivirus“, die zusammen als Klosneuviren (vorgeschlagene Familie „Klosneuvirinae“) bezeichnet werden.

Mit Stand 6. Mai 2023 ist die Gattung „Hokovirus“ noch nicht vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt (Master Species List #38).

Phylogenien der Klosneuviren, die die Gattung „Hokovirus“ bzw. die Spezies „Hokovirus HKV1“ einschließen, finden sich beispielsweise bei Disa Bäckström et al. (2019), Fig. 3, bei Aylward et al. (2021), oder unter Klosneuvirinae §Systematik: Kladogramm.

Einzelnachweise

  1. 1 2 3 4 5 ICTV Master Species List 2019.v1. ICTV, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35).
  2. 1 2 3 ICTV: Master Species Lists § ICTV Master Species List 2022 MSL38 v1 (xlsx), 8. April 2023.
  3. ↑ Hokovirus (genus). NCBI (genus); abgerufen am 7. Mai 2023.
  4. 1 2 Frank O. Aylward, Jônatas S. Abrahão, Corina P. D. Brussaard C, Matthias G. Fischer, Mohammad Moniruzzaman, Hiroyuki Ogata, Curtis A. Suttle: Create 3 new families, 3 subfamilies, 13 genera, and 20 new species within the order Imitervirales (phylum Nucleocytoviricota) and rename two existing species (zip:docx). Vorschlag 2022.004F an das ICTV vom Oktober 2021.
  5. ↑ Hokovirus HKV1 (species). . NCBI (genus); abgerufen am 7. Mai 2023.
  6. 1 2 3 4 5 Frederik Schulz, Natalya Yutin, Natalia N. Ivanova, Davi R. Ortega, Tae Kwon Lee, Julia Vierheilig, Holger Daims, Matthias Horn, Michael Wagner: Giant viruses with an expanded complement of translation system components. In: Science. Nr. 6333, 7. April 2017, S. 82–85, doi:10.1126/science.aal4657 (englisch, sciencemag.org).
  7. ↑ David M. Needham, Susumu Yoshizawa, Toshiaki Hosaka, Camille Poirier, Chang Jae Choi, Elisabeth Hehenberger, Nicholas A. T. Irwin, Susanne Wilken, Cheuk-Man Yung, Charles Bachy, Rika Kurihara, Yu Nakajima, Keiichi Kojima, Tomomi Kimura-Someya, Guy Leonard, Rex R. Malmstrom, Daniel R. Mende, Daniel K. Olson, Yuki Sudo, Sebastian Sudek, Thomas A. Richards, Edward F. DeLong, Patrick J. Keeling, Alyson E. Santoro, Mikako Shirouzu, Wataru Iwasaki, Alexandra Z. Worden: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators. In: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, inklusive: Supplement 1 (xlsx).
  8. ↑ Disa Bäckström, Natalya Yutin, Steffen L. Jørgensen, Jennah Dharamshi, Felix Homa, Katarzyna Zaremba-Niedwiedzka, Anja Spang, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Thijs J. G. Ettema: Virus Genomes from Deep Sea Sediments Expand the Ocean Megavirome and Support Independent Origins of Viral Gigantism. In: mBio, Band 10, Nr. 2, 2019; doi:10.1128/mBio.02497-18.
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