Gründung

1548 zählte die theologische Fakultät an der von Herzog Ludwig dem Reichen gegründeten bayerischen Universität Ingolstadt nur einen Professor. Nachdem Herzog Wilhelm IV. vergeblich die Universitäten von Paris, Löwen und Köln um Hilfe gebeten hatte, berief er 1549 die ersten Jesuiten nach Ingolstadt. Papst Paul III. veranlasste den Ordensgründer Ignatius von Loyola, diesem Anliegen zu entsprechen. Noch im selben Jahr kamen mit Claudius Le Jay, Petrus Canisius und Alfonso Salmerón die ersten Jesuiten in Ingolstadt an und begannen mit ihren Vorlesungen an der Universität. Sie gewannen aber zusammen mit dem anderen Theologen nur 14 Hörer. Eine Verbesserung der Situation versprachen sich die Jesuiten von einem Gymnasium als Vorstufe, und so schlugen sie dem Herzog die Gründung eines Kollegs vor. Dieser unterstützte das Vorhaben, starb aber vor dessen Ausführung, und die Jesuiten wurden 1550 abberufen.

Übernahme der Universität

Herzog Albrecht V. verhandelte 1555 neu und vereinbarte mit Petrus Canisius die Gründung eines Jesuitenkollegs und die Übernahme von zwei Lehrstühlen der theologischen Fakultät durch die Jesuiten, während die artistische (philosophische) Fakultät von ihnen erst später übernommen werden sollte. 1556 wurden von Ignatius von Loyola 18 Mitglieder des Ordens von Rom nach Ingolstadt entsandt, darunter sieben Deutsche und zwei Österreicher; wenig später kam auch Petrus Canisius. Das Gymnasium wurde am 23. Oktober 1556 neu eröffnet. Mit dessen weltlichem Lehrkörper herrschte eine beständige Spannung und Auseinandersetzung über die Zuständigkeit für Promotion und Disziplin.

Das noch bestehende Pädagogium und die neue Jesuitenschule gerieten in Streitigkeiten, die der Herzog auflöste, indem er die ältere der beiden Schulen 1571 ebenfalls den Jesuiten übertrug und somit beide Einrichtungen vereinigte.

Die neue Schule umfasste die Klassen Grammatica, Poetica, Syntax minor, Syntax maior und Rhetorica. Als Schulgebäude diente ein Neubau neben dem Liebfrauenmünster, das heutige Canisiuskonvikt, das 1584 bezogen wurde und seit 1612 unter dem Namen „Gymnasium Ignatii“ firmierte. Berühmtester Schüler dieser Zeit war der spätere Kaiser des Heiligen Römischen Reiches Deutscher Nation, Ferdinand II., der 1590 als Zwölfjähriger nach Ingolstadt kam. Das Hauptgewicht in dieser Schule lag auf der Unterweisung in Latein und Griechisch, daneben wurden aber auch Musik und Chorgesang gepflegt, nicht im Lehrplan enthalten waren dagegen Deutsch und jede Art von Naturwissenschaft.

Herzog Wilhelm V. machte dem ein Ende, indem er 1585 die ganze artistische Fakultät der Gesellschaft Jesu übertrug. Nunmehr stellten die Jesuiten acht Professoren: zwei Theologen, drei Philosophen und je einen für Mathematik, Dialektik und hebräische Sprache. Professoren, wie beispielsweise Philipp Apian, die sich zum Protestantismus bekannten, mussten die Universität verlassen. 1600 erhielten die Ingolstädter Jesuiten auch die Leitung des von dem Regensburger Propst Quirinus Leoninus gestifteten Seminars vom hl. Hieronymus.

Ab 1675 hatten die Jesuiten auch den Lehrstuhl für Kirchenrecht inne. Bei der Neuordnung des Unterrichtswesens im 18. Jahrhundert errichteten sie einen Lehrstuhl für allgemeine Geschichte.

Das angeschlossene Ingolstädter Jesuitengymnasium genoss einen hervorragenden Ruf, dem viele, auch adelige Schüler aus dem gesamten Gebiet des damaligen Deutschen Reiches folgten. Nach dem Dreißigjährigen Krieg, unter dem Ingolstadt schwer zu leiden hatte, schrumpfte die Schülerzahl und verharrte auf dem Stand von etwa 200.

Bis 1762 war das Ingolstädter Jesuitenkolleg auch Verwaltungssitz der oberdeutschen Provinz des Ordens; der Nachwuchs dieser Provinz studierte hier.

Aufhebung

Die Aufhebung des Jesuitenordens erfolgte 1773 durch Papst Clemens XIV. auf Druck der Könige von Frankreich, Spanien und Portugal. Auf die ehemaligen Jesuiten im Lehrkörper der Universität konnte aber nicht verzichtet werden.

Als 1799 die Universität nach Landshut verlegt wurde, schloss Kurfürst Maximilian IV. Joseph aus Kostengründen das Gymnasium. In der Folge wurde Ingolstadt mehr und mehr in eine Festungs- und Garnisonsstadt umgewandelt, was mit dem gleichzeitigen Fehlen nennenswerter Bildungseinrichtungen einen herben Schlag für die Stadt bedeutete.

Ehemalige Schüler

• Philipp Eduard Fugger (1546–1618), Kaufmann und Bankier
• Ferdinand von Bayern (1577–1650), Kurfürst und Erzbischof von Köln
• Ferdinand II. (HRR) (1578–1637), Kaiser des Heiligen Römischen Reiches
• Albrecht VI. (Bayern-Leuchtenberg), bayerischer Landesadministrator von 1651 bis 1654
• Abraham a Sancta Clara (1644–1709), bedeutender katholischer Prediger
• Adam Weishaupt (1748–1830), bayerischer Aufklärer und Gründer des Illuminatenordens
• Johann Andreas Schmeller (1785–1852), Germanist und bayerischer Sprachforscher