Verein

Junker hatte in seiner Jugend bei Vinding SF und beim FC Djursland gespielt, ehe er sich SK Freja Randers anschloss, einem der Vereine innerhalb des Randers FC. Er kam ab März 2014 in der ersten Mannschaft von Randers FC in der Saison 2013/14 zu fünf Einsätzen und belegte mit seinem Verein den siebten Tabellenplatz. In der Wintertransferperiode der Saison 2014/15 wechselte er leihweise bis Saisonende zum Zweitligisten FC Fredericia, absolvierte allerdings kein Spiel. In der Saison 2015/16 belegte Junker mit Randers FC den sechsten Tabellenplatz.

Im Sommer 2016 wechselte er zu Aarhus GF. In den Saisons 2016/17 und 2017/18 gelang ihm mit dem Verein jeweils nach den Abstiegs-Playoffs der Klassenerhalt. 2018 ging er dann weiter zum Ligarivalen AC Horsens und wurde von dort ein Jahr später an Stabæk Fotball in Norwegen verliehen. Die Saison 2020 verbrachte der Stürmer bei FK Bodø/Glimt und erzielte dort in 25 Ligaspielen die Anzahl von 27 Treffern und konnte mit dem Verein erstmals die norwegische Meisterschaft und für sich den Titel als Torschützenkönig feiern.

Kurz vor Beginn der neuen Saison wechselte er dann am 1. April 2021 zum japanischen Erstligisten Urawa Red Diamonds. Am 19. Dezember 2021 stand er mit dem Klub im Endspiel des Kaiserpokals, dass man mit 2:1 gegen Ōita Trinita gewann. Am 1. Februar 2023 wechselte er auf Leihbasis zum ebenfalls in der ersten Liga spielenden Nagoya Grampus.

Nationalmannschaft

Junker spielte fünfmal für die dänische U20-Nationalmannschaft und viermal für die dänische U21-Nationalmannschaft. Bei der U21-Europameisterschaft 2017 in Polen gehörte er zum dänischen Kader, kam allerdings zu keinem Einsatz.