FC Schalke 04

Nach vier Jahren in den Jugendmannschaften des FC Schalke 04 schaffte da Silva Pinto 1999 den Sprung in die Profimannschaft und absolvierte dort bis 2004 23 Bundesligaspiele für Schalke und vier Spiele im UEFA-Pokal.

Alemannia Aachen

Vor der Saison 2004/05 wechselte da Silva Pinto auf Leihbasis zu Alemannia Aachen in die 2. Bundesliga. Er gab als Saisonziel den Aufstieg in die erste Fußball-Bundesliga aus. Zu seinem Einstand für die Alemannia kam er am 13. August 2004 beim 1:1 am ersten Spieltag der 2. Bundesliga 2004/05 im Spiel gegen LR Ahlen in der Anfangself. Er verschoss einen Strafstoß und wurde nach 60 Minuten durch Florian Bruns ersetzt. Der Flügelspieler kam in seiner ersten Spielzeit zu 27 Partien und erzielte vier Tore. Zudem absolvierte er für Aachen sieben Spiele und gab zwei Vorlagen im UEFA-Pokal, für den man sich durch den DFB-Pokalfinal-Einzug 2004 qualifiziert hatte. Dort erreichte er mit der Mannschaft das Sechzehntelfinale, in dem man gegen AZ Alkmaar ausschied. Im Mai 2005 erhielt da Silva Pinto bei Alemannia Aachen eine Festanstellung bis 2007.

In der Saison 2005/06 stieg er mit der Alemannia in die Bundesliga auf. In der Aufstiegssaison erzielte er mit einem Fernschuss das Tor des Monats im November 2005 der ARD-Sportschau gegen den SC Paderborn 07.

Hannover 96

Im Sommer 2007 wechselte da Pinto mit einem Dreijahresvertrag zu Hannover 96. Hier spielte er zunächst auf der rechten Außenbahn. In der Rückrunde 2007/08 wurde gegen ihn nach zwei kurz aufeinander folgenden Roten Karten vereinsintern eine Strafe verhängt.

Im Abstiegskampf der Saison 2009/10 spielte er wochenlang trotz eines gerissenen Außenbandes im Knie und trug als Führungsspieler zum Klassenerhalt bei. Am Ende der Saison 2009/10 wurde der auslaufende Vertrag um drei Jahre verlängert.

In der Saison 2010/11 wurde Hannover 96 mit Pinto Vierter, was zur Teilnahme an der Europa League berechtigte. Hier setzte sich 96 gegen den favorisierten FC Sevilla durch und schied erst im Viertelfinale gegen späteren Cupgewinner Atlético Madrid aus. In der Bundesliga erreichte Hannover 96 den siebten Platz, der zur erneuten Teilnahme an der Qualifikation zur Europa League berechtigte. Zu Beginn der Saison 2012/13 leitete da Silva Pinto in der ersten Runde des DFB-Pokals mit zwei Toren den Sieg über den FC Nöttingen ein. Mit Ablauf der Saison 2012/13 erhielt er keinen neuen Vertrag und verließ den Verein.

Levante UD

Im Juli 2013 verpflichtete der spanische Club Levante UD aus Valencia Pinto. Er erhielt einen Zweijahresvertrag. Sein Pflichtspieldebüt in der Primera División gab er am 15. August 2013 am ersten Spieltag bei der 0:7-Auswärtsniederlage beim FC Barcelona. Zur Halbzeit lag die Mannschaft mit 0:6 zurück und da Silva Pinto wurde ausgewechselt. Er gab am 21. September 2013 am fünften Spieltag gegen UD Almería (2:2) eine Torvorlage. In der Liga kam er zu 18 Einsätzen, in der Copa del Rey spielte er mit UD Levante erneut im Camp Nou; die Valencianer führten mit 1:0 und verloren am Ende mit 1:5. Pinto musste aufgrund einer Muskelquetschung bereits in der ersten Halbzeit ausgewechselt werden.

Fortuna Düsseldorf

Zur Saison 2014/15 wurde Pinto von Fortuna Düsseldorf verpflichtet. Er erhielt einen Zweijahresvertrag. Der Wechsel kam durch seine Freundschaft mit Sascha Rösler, mit dem er bei Alemannia Aachen zusammengespielt hatte, zustande. Im Oktober 2014 brach er sich im Spiel gegen den FC Ingolstadt 04 den Kiefer, im April 2015 erneut im Training. Danach hat er aus gesundheitlichen Gründen kein Spiel mehr für die Fortuna bestritten und wurde zum Ende der Saison 2015/16 verabschiedet.

Am 1. Juni 2016 gab Pinto wegen der Kieferverletzung das Ende seiner Fußballkarriere bekannt.