Vereinskarriere

Héctor Pinto spielte in den Jugendmannschaften von Comercio, CSD Colo-Colo und schließlich Universidad de Chile, wo er 1970 sein Debüt in der Primera División gab. 1977 kehrte der Mittelfeldspieler zu seinem Jugendklub Colo-Colo zurück, wo er zwei Saisons spielte und dann zu Unión Española ging. Dort beendete Pinto 1984 seine Karriere.

Nationalmannschaftskarriere

Für Chile debütierte Héctor Pinto bei der Copa Carlos Dittborn 1974 gegen Argentinien. Der Mittelfeldspieler absolvierte bis 1977 zehn Länderspiele, darunter zwei Qualifikationsspiele für die Fußball-Weltmeisterschaft 1978. Sein einziges Länderspieltor gelang Pinto bei der Copa Juan Pinto Durán 1975 gegen Uruguay.

Trainerkarriere

Nach seinem Rücktritt als Profispieler begann Héctor Pinto seine Karriere als Trainer bei Unión Española, seiner letzten aktiven Karrierestation. Danach trainierte er die Jugendmannschaften von Universidad de Chile. Im Jahr 2000 trainierte der frühere Nationalspieler die U23-Nationalmannschaft beim olympischen Qualifikationsturnier, so dass sich Chile für die Olympischen Spiele 2000 in Sydney qualifizierte. Im Folgejahr betreute er die U20 bei der Junioren-Fußballweltmeisterschaft 2001 in Argentinien. Das Team Pintos schied nach nur einem Sieg in der Vorrunde aus.

Im Dezember 2003 unterschrieb Pinto für das Folgejahr bei seinem langjährigen Verein Universidad de Chile, mit denen er die Apertura 2004 Meister wurde. Im Finale der Playoffs wurde der CD Cobreloa mit 4:2 im Elfmeterschießen besiegt. Bei der Clausura 2005 kam La U unter Pinto erneut ins Finale, scheiterte aber diesmal im Elfmeterschießen an der Universidad Católica. Darauf trat der Coach bei den Azules zurück. 2007 coachte Pinto Unión Española und ging dann als Trainer in die Jugend des mexikanischen Klubs Cruz Azul. Von Mai bis August 2014 coachte Pinto Deportes Iquique. 2017 trainierte der Chilene die Reservemannschaft des chinesischen Klubs Hebei Fortune, wo er eng mit Trainer Manuel Pellegrini zusammenarbeitete.