Golden☆Lovers (2010–2014)

Zeitgleich zu seinem Engagement bei DDT trat Smith nebenher auch für New Japan an. Er nahm von 2010 bis 2014 an jedem Best of the Super Juniors-Turnier teil, konnte aber keines von diesen gewinnen. Nichtsdestotrotz gewann er am 11. Oktober 2010 zusammen mit Kota Ibushi die IWGP Junior Tag Team Championship.

Bullet Club (2014–2017)

Smith gab während einer Pressekonferenz am 3. Oktober 2014 bekannt, dass er seinen Vertrag mit DDT nicht verlängern wird und stattdessen voll bei New Japan Pro Wrestling unterschreibt. Er debütierte am 8. November 2014 als Vollzeitwrestler bei New Japan bei der Show Power Struggle, wo er von Karl Anderson als neustes Mitglied des Bullet Clubs vorgestellt wurde. Er forderte den dato amtierenden IWGP Junior Heavyweight Champion Ryusuke Taguchi heraus, den er am 4. Januar 2015 bei Wrestle Kingdom auch besiegen durfte. Smith hielt den Titel 182 Tage und gab ihn am 5. Juli 2015 bei Dominion 7.5 an Kushida ab, ehe er ihn am 23. September 2015 wieder zurückerhielt. Die Regentschaft endete aber am 4. Januar 2016 bei Wrestle Kingdom 10, wo er den Titel wieder an Ryusuke Taguchi abgab.

Einen Tag nach der Niederlage gegen Taguchi trat Smith mit seinem Stablekollegen AJ Styles, der zu dem Zeitpunkt Anführer des Bullet Clubs war, in einem Tag Team-Match auf die CHAOS-Mitglieder Shinsuke Nakamura und Yoshi-Hashi, welches sie auch gewannen. Nach dem Match verpasste Smith Styles seinen Finisher, den One-Winged Angel. Kurz darauf stießen weitere Mitglieder wie die The Young Bucks, Karl Anderson, Doc Gallows und Cody Hall hinzu und schlossen sich dem Angriff auf Styles an. Smith erklärte sich zum neuen Anführer des Bullet Clubs und feuerte Styles. Hintergrund war, dass dieser daraufhin New Japan verließ und kurze Zeit später zur WWE wechselte. Einen Monat später, am 14. Februar 2016, gewann Smith ein Match gegen Hiroshi Tanahashi und gewann so den vakanten IWGP Intercontinental Championship, da der vorherige Titelträger Shinsuke Nakamura ebenfalls zur WWE ging. Die Woche darauf durfte er den nächsten Titel gewinnen, zusammen mit den Young Bucks gewann er die NEVER Six Men-Tag Team Championship.

Smith nahm im Sommer 2016 bei New Japans größtem Turnier teil, dem G1 Climax. Obwohl er das erste Match gegen Yoshi-Hashi verlor, konnte er dennoch den Gruppensieg und damit auch die Finalteilnahme sichern. Dieses gewann er letztendlich gegen Hirooki Goto und hatte somit das Recht gewonnen, ein Titelmatch um die IWGP Heavyweight Championship bei Wrestle Kingdom 11 am 4. Januar 2017 zu erhalten, sollte er dieses bis dorthin verteidigen, was er nach weiteren Siegen gegen Yoshi-Hashi und Goto auch konnte. Im Titelmatch selbst unterlag er dem Champion Kazuchika Okada, das Match wurde aber von Fans und Kritikern überschwänglich gelobt. Der bekannte Wrestling-Journalist Dave Meltzer vom Wrestling Observer, der als Fan von New Japan gilt, vergab diesem Match sogar sechs Sterne, obwohl seine Skala nur bis fünf ging.

Im Verlaufe des Jahres trat Smith zumeist mit den Young Bucks an, mit denen er eine Untergruppierung innerhalb des Bullet Clubs bildete, die Elite. Dies taten sie nicht nur bei New Japan, sondern auch bei Ring of Honor, wo die Young Bucks unter Vertrag stehen. Im Zuge der Expansion in die USA führte New Japan die IWGP United States Championship ein und ließ diesen in einem Turnier ausfechten, an dem auch Smith teilnahm. Mit Siegen über Michael Elgin, Jay Lethal und Tomohiro Ishii gewann Smith Turnier und Titel. Er trat zudem erneut beim G1 Climax an und schaffte es erneut ins Finale. Den Vorjahrestriumph konnte er jedoch nicht wiederholen und verlor im Finale gegen Tetsuya Naito.

Bei der Show Power Struggle 2017 am 5. November 2017 verteidigte Smith den IWGP United States Title gegen Barretta. Nach dem Match erschien der ehemalige WWE-Wrestler Chris Jericho auf der Videoleinwand und forderte Smith zu einem Titelmatch bei Wrestle Kingdom 12 am 4. Januar 2018 heraus, um zu klären, wer der beste Wrestler aus dem Raum Winnipeg sei. Im Verlauf griff Jericho Smith wiederholt an, welcher mit gleicher Münze zurückschlug. Den Kampf bei Wrestle Kingdom, welches ein No Disqualification-Match war, gewann Smith schließlich.

Uneinigkeit im Bullet Club und Wiedervereinigung der Golden☆Lovers (2017–2019)

Schon im Vorfeld gab es Spannungen zwischen Smith und dem dazugestoßenen Bullet Club-Mitglied Cody. Diese eskalierten immer mehr, als Cody Smiths früheren Tag Team-Partner Kota Ibushi, der mittlerweile auch fest bei New Japan unter Vertrag war, angriff und Smith dazwischenging. Am zweiten Tag der New Beginning in Sapporo-Showreihe gab Smith den IWGP United States Title an Jay White ab. Nachdem Smiths Stablekollege Hangman Page den Titelgürtel an sich riss, übergab Smith den Titel freiwillig an White. Dies führte zu einer Konfrontation zwischen den Mitgliedern des Bullet Clubs, welche darin gipfelten, dass Cody seinen Finisher an Smith verpasste und diesen weiter angreifen wollte, bis Kota Ibushi den Save machte. Daraufhin versöhnten sich Smith und Ibushi, die daraufhin die Golden Lovers wieder ins Leben riefen.

Daraufhin fehdete Smith mit Cody um den Anführerposten im Bullet Club. Cody selbst versuchte insoweit die anderen Mitglieder im Bullet Club, allen voran die Young Bucks, die immer noch mit Smith befreundet sind, gegen diesen zu intrigrieren. Die erste direkte Auseinandersetzung bei ROH Supercard of Honor XII gewann Cody durch misslungene Superkicks der Young Bucks, die aus Versehen Smith trafen. Diese Niederlage traf Smith hart und er distanzierte sich immer mehr von ihnen und vertiefte seine Freundschaft mit Kota Ibushi, die daraufhin vermehrt als Golden Lovers auftraten, u. a. gegen die Young Bucks.

Am 9. Juni 2018 bekam Smith die zweite Chance auf den IWGP Heavyweight Championship und traf bei Dominion 6.9 erneut auf Kazuchika Okada, dieses Mal in einem 2 out 3 Falls-Match ohne Zeitlimit. Okada konnte zwar nach 29 Minuten den ersten Fall erzielen, Smith konterte aber nach 48 Minuten und nach 64 Minuten gelang ihm der entscheidende Fall, womit er IWGP Heavyweight Champion wurde. Ähnlich wie bei ihrer ersten Begegnung 18 Monate zuvor, wurde dieses Match überschwänglich gelobt und Meltzer vergab sogar sieben Sterne. Mit dem Titelgewinn versöhnte er sich mit den Young Bucks, die am selben Abend die IWGP Tag Team Championship gewannen. Einen Monat später verteidigte Smith seinen Titel gegen Cody, wurde aber im Endsegment der Show von anderen Mitgliedern des Bullet Clubs angegriffen, nämlich den Guerillas of Destiny und deren Vater Haku, die sich von den Mitgliedern der Elite abspalteten und mit den Bullet Club OGs eine eigene Untergruppierung aufmachten. Cody wurde angeboten, Smith mit einem Stuhl niederzustrecken, doch Cody stellt sich wieder auf die Seite Smiths' und versöhnte sich wieder mit ihm, wurde dafür aber auch niedergeschlagen.

Daraufhin nahm Smith am G1 Climax 2018 teil, konnte sich aber diesmal nicht für das Finale qualifizieren, da er sich im finalen Match um den Gruppensieg seinem Freund Kota Ibushi geschlagen geben musste. Während der Chris Jericho's Rock'n'Wrestling: Rager at Sea-Tour gab die Elite bekannt, nicht mehr länger Teil des Bullet Clubs zu sein. Am 4. Januar 2019 bei Wrestle Kingdom 13 verlor Smith den Titel an Hiroshi Tanahashi und kündigte damit auch an, dass er New Japan Pro Wrestling verlassen wird.

Rückkehr 2023

Am 4. Januar 2023 kehrte Omega, der inzwischen bei All Elite Wrestling unter Vertrag stand, in den NJPW-Ring zurück und gewann bei Wrestle Kingdom 17 die IWGP United States Heavyweight Championship gegen Will Ospreay. Das Match bekam überaus positive Kritik und wurde von Dave Meltzer mit 6,25 Sternen ausgezeichnet, dem zweithöchsten Rating, das Meltzer in seinem renommierten Wrestling Observer Newsletter je vergab.